Afficher une forme par dessu une autre

Quelques autres remarques sur ton code :

1)

package evenement_souris.fr;

Dans un nom de package on ne devrait pas avoir de

_

et les différents champs doivent être du plus générique (dossier parent) vers le plus spécifique (sous-dossier), dans ton cas on devrait donc avoir :

package fr.evenement.souris;

(avec les dossiers qui vont bien)

2)

public class Fenetre extends JFrame implements MouseListener

Il vaut mieux séparer dans des classes distinctes, l'objet manipulé (JFrame) et l'objet qui le manipule (MouseListener), cela évite des classes fourre-tout et du code comme

this.addMouseListener(this);

où en réalité

this

est deux choses différentes (une JFrame à gauchen un MouseListener à droite).

3)

this.getContentPane().add(rond);

D'une part, le this est facultatif (et ce qui est facultatif ne devrait pas être mis, ça alourdit le code), d'autre part la classe JFrame étant également un Container, elle a déjà une méthode add, il est donc inutile de passer par le contentPane.

4)

public void mouseClicked(MouseEvent arg0) {}

Pour simplifier ton MouseListener et éviter l'implémentation de méthodes vides, tu peux utiliser un MouseAdapter et ne surcharger que les méthodes que tu veux définir.

5)

this.getContentPane().add(new Carre(Color.GREEN));

Attention, à chaque clic tu vas créer et ajouter un nouvel objet, est-ce bien ce que tu veux faire ?
Si tu veux n'afficher qu'une seule fois le carré ou si tu as l'intention de cliquer beaucoup de fois et d'afficher plein de carrés, cela semble une mauvaise approche.

Code corrigé avec mes remarques :

package fr.evenement.souris;

import java.awt.Color;
import java.awt.event.MouseAdapter;
import java.awt.event.MouseEvent;

import javax.swing.JFrame;

public class Fenetre extends JFrame {    
    private Rond rond = new Rond();
    private Carre carre = null;

    public Fenetre() {
        setTitle("EvenementSouris");
        setLocationRelativeTo(null);
        setDefaultCloseOperation(EXIT_ON_CLOSE);
        setSize(800, 800);

        add(rond);
        addMouseListener(new MouseAdapter() {
            @Override
            public void mousePressed(MouseEvent event) {
                if (carre == null) {
                    carre = new Carre(Color.GREEN);
                    add(carre, 0);
                    validate();
                }
            }
        });

        setVisible(true);
    }
}