Error while loading shared libraries: libpapi.so.5.4.3.0 [Résolu/Fermé]

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Bonjour,

Je viens ici car vraiment cette erreur me rend complètement dingue.

je compile un programme avec scalasca, et à l'analyse de l’exécutable il me dit qu'il ne trouve pas cette foutue libpapi.

"./a.out: error while loading shared libraries: libpapi.so.5.4.3.0: cannot open shared object file: No such file or directory"


bien surs elle est bien installée sur ma machine, et se trouve bien dans mon $LD_LIBRARY_PATH

quand je fais un ldd sur mon exécutable, je confirme qu'il ne trouve pas :

$ ldd a.out 

linux-vdso.so.1 (0x00007ffc91181000)
libcube4w.so.7 => /opt/scorep/lib/libcube4w.so.7 (0x00007fc423885000)
libcubewriter4.so.7 => /opt/scorep/lib/libcubewriter4.so.7 (0x00007fc423681000)
libz.so.1 => /lib64/libz.so.1 (0x00007fc423423000)
libdl.so.2 => /lib64/libdl.so.2 (0x00007fc42321f000)
libpapi.so.5.4.3.0 => not found
libstdc++.so.6 => /lib64/libstdc++.so.6 (0x00007fc422e9c000)
libm.so.6 => /lib64/libm.so.6 (0x00007fc422b9a000)
libgcc_s.so.1 => /lib64/libgcc_s.so.1 (0x00007fc422982000)
libc.so.6 => /lib64/libc.so.6 (0x00007fc4225c1000)
/lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x000055918a7cc000)


$ locate  libpapi.so.5.4.3.0

/usr/local/lib/libpapi.so.5.4.3.0


$ echo $LD_LIBRARY_PATH
/usr/local/lib64/:/usr/lib:/usr/local/lib/:/home/ilasri/soft/cube/cube-4.3.3/lib:/home/ilasri/soft/scalasca/scalasca-2.2.2/lib:/home/ilasri/soft/scorep/scorep-1.4.2/lib:/home/ilasri/soft/uuid/lib:/home/ilasri/soft/openmpi/openmpi-2.0.2/lib



$ file /usr/local/lib/libpapi.so.5.4.3.0
/usr/local/lib/libpapi.so.5.4.3.0: ELF 64-bit LSB shared object, x86-64, version 1 (SYSV), dynamically linked, BuildID[sha1]=1519b2cccf28ca21b690d129c5f33987c8db3c7a, not stripped


je ne sais pas quoi faire d'autre à part exploser mon ordinateur ou changer de métier (que la paix et l'amour soient avec moi)

Merci à toute personne qui peut me venir en aide !

bonne journée

4 réponses

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Bonjour,

Ma réponse sera en deux temps (comment on procède pour faire les choses proprement, et ensuite, comment rattraper ton installation). À toi de voir si tu essayes de réparer ou de repartir sur une installation propre.

A) La manière propre

La manière propre de résoudre un problème de librairie non trouvée sous linux consiste à

1) ... vérifier s'il existe un paquet qui fournit la librairie manquante.

- Pour les distributions basées sur apt (debian, ubuntu, ...), cela se fait avec
apt-file
.
- Apparemment pour les distributions basées sur rpm (fedora, redhat...), cela se fait avec
rpm -qa
(voir ce site)

Exemple : (sous debian, car je n'ai pas de distribution basée sur rpm sous la main) :

(mando@aldur) (~) $ apt-file search libpapi.so
libpapi-dev: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpapi.so
libpapi5: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpapi.so.5
libpapi5: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpapi.so.5.5.1.0


Ici on voit que le paquet s'appelle
libpapi5
.

Note : je suppose que dans ton cas ce serait
rpm -qa | grep libpapi


2) ... installer le paquet s'il existe

Si un tel paquet existe, l'installer suffira à résoudre le problème. Pour une distribution basée sur apt, ce serait typiquement la commande apt-get. Sous fedora, j'imagine que c'est yum ou dnf qui sera utilisé.

Exemple : (sous debian, car je n'ai pas de distribution basée sur rpm sous la main) : en root :

apt-get update
apt-get install libpapi5


Note : dans ton cas j'imagine que ce serait quelque chose du genre
yum update
et
yum install libpapi5
.

3) ... et sinon installer la librairie autrement

Il faut chercher le site officiel du projet qui fournit soit des sources à compiler et à installer (i.e. un dépôt git), soit des archives prêtes à l'emploi.

Il semble que dans le cas présent, les sources soient disponibles sur git. Même si installer ainsi ta librairie est faisable, l'installation est plus fastidieuse et moins propre, donc je t'invite à privilégier l'installation par paquet (i.e. via
yum
).

B) Dans ton cas

Tu as choisi l'option (3) apparemment. Mais la librairie n'est pas trouvée, probablement parce que tu n'as pas lancé
ldconfig
après l'avoir installé.

Bonne chance
1
Merci

Quelques mots de remerciements seront grandement appréciés. Ajouter un commentaire

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Merci pour ta réponse,

justement comme tu l'as bien dit, j'ai installé papi en compilant le code source.

mais bon... j'ai suivi quand même ce que tu as dit avec rpm :

 $ rpm -qa | grep papi
papi-libs-5.4.1-3.fc23.x86_64
papi-5.4.1-3.fc23.x86_64


$sudo dnf install papi-libs-5.4.1-3.fc23.x86_64
Vérification de l'expiration des métadonnées effectuée il y a 1:58:38 sur Thu Oct 26 11:47:46 2017.
Le paquet papi-libs-5.4.1-3.fc23.x86_64 est déjà installé, ignorer
Dépendances résolues.
Rien à faire.
Terminé !

$ sudo dnf install papi-5.4.1-3.fc23.x86_64
Vérification de l'expiration des métadonnées effectuée il y a 1:58:46 sur Thu Oct 26 11:47:46 2017.
Le paquet papi-5.4.1-3.fc23.x86_64 est déjà installé, ignorer
Dépendances résolues.
Rien à faire.
Terminé !



je relance mon excécutable :

./a.out: error while loading shared libraries: libpapi.so.5.4.3.0: cannot open shared object file: No such file or directory



O_O AAAAHHHHHHHHHHH :'( :'(
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En fait je l'ai installé à la main car il n'y avait pas la bonne version RPM,

mais je ne comprends pas pourquoi il ne trouve pas. :/
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hello
comme suggéré précedemment, essayer
sudo ldconfig -v
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Quand j'utilise libpapi ailleurs ça trouve bien, mais avec ce code précis ça ne trouve pas, je ne saurai dire pourquoi.

à savoir que je fait une instrumentation avec scalasca, j'utilise exactement les même flag pour deux codes différents. Un ça trouve, l'autre ne trouve pas... comment ne pas casser son ordi avec ça?

Y a pas moyen de dire à l'exécutable que ta libraire se trouve ICI ?
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Bon allé c'est bon !

j'ai fini par tout désinstallé et tout réinstallé et ça a enfin marché ! :)

merci pour vos réponses. Très bonne journée à tous
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Merci pour ton retour, bonne continuation !
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Quelle librairie n'est pas trouvée (peux-tu reporter le message d'erreur correspondant) ?

As-tu regardé si la librairie (fichier
.so
) qui n'est pas trouvée était dans un répertoire standard (e.g.
/usr/local/lib
) ? Si ce n'est pas le cas, tu as peut être juste oublié de faire
sudo make install
?

Pour répondre à ta dernière question, tu peux au moment de compiler passer des options de compilation pour compléter la liste de répertoires où chercher des librairies.
https://forums.commentcamarche.net/forum/affich-27031310-compiler-avec-une-librairie-partagee#3

Bonne chance