Fade out puis fade in javaFX

Bonjour,
je suis en train de faire une application en javafx, celle ci est composée d'une page de bienvenue avant l'arrivée sur le menu. Les effets sont un fade in du welcome, un fade out puis un fade in du
menu.
Les effets fonctionnent. Cependant, avant l'apparition progressive du menu, j'ai une sorte de flash du menu. Je ne vois pas quel est le probleme.

Si vous pouviez m'aider,
merci !

package application;


import java.io.File;
import java.io.IOException;
import java.net.URL;
import java.text.DateFormat;
import java.text.SimpleDateFormat;
import java.util.Date;
import java.util.ResourceBundle;

import javafx.animation.Animation;
import javafx.animation.FadeTransition;
import javafx.animation.KeyFrame;
import javafx.animation.Timeline;
import javafx.fxml.FXML;
import javafx.fxml.FXMLLoader;
import javafx.fxml.Initializable;
import javafx.scene.layout.AnchorPane;
import javafx.scene.layout.StackPane;
import javafx.scene.text.Text;
import javafx.util.Duration;

public class MyController implements Initializable {

  @FXML
  private Text now;
  @FXML
  private Text update;

  @FXML
  private AnchorPane rootAP;

  @Override
  public void initialize(URL location, ResourceBundle resources) {

	  if(!Main.isSplashLoaded){
		  loadSplashScreen();
	  }

	File file = new File("resources/bg2.jpg");
	File date2 = new File("resources/bg8.jpg");
	if(!file.exists() || !date2.exists()){
		System.out.println("Erreur de fichier");
		System.exit(0);
	} else {
		SimpleDateFormat sdf = new SimpleDateFormat("dd/MM/yyyy HH:mm:ss");

		String last;
		if(date2.compareTo(file) > 0){
			last = sdf.format(date2.lastModified());
		}else {
			last = sdf.format(file.lastModified());
		}
		update.setText("Dernière mise à jour: "+last);

		Timeline clock = new Timeline(new KeyFrame(Duration.ZERO, e -> {
				DateFormat mediumDateFormat = DateFormat.getDateTimeInstance(DateFormat.MEDIUM,DateFormat.SHORT);
				Date date = new Date();
				now.setText(mediumDateFormat.format(date));
	    	}),
	        new KeyFrame(Duration.seconds(1))
	    );
	    clock.setCycleCount(Animation.INDEFINITE);
	    clock.play();
	}

  }

  private void loadSplashScreen(){
	  try {

		Main.isSplashLoaded = true;
		StackPane pane = FXMLLoader.load(getClass().getResource(("Splash.fxml")));
		rootAP.getChildren().setAll(pane);

		FadeTransition fadeIn = new FadeTransition(Duration.seconds(3),pane);
		fadeIn.setFromValue(0);
		fadeIn.setToValue(1);
		fadeIn.setCycleCount(1);

		FadeTransition fadeOut = new FadeTransition(Duration.seconds(3),pane);
		fadeOut.setFromValue(1);
		fadeOut.setToValue(0);
		fadeOut.setCycleCount(1);

		fadeIn.play();
		fadeIn.setOnFinished((e)->{fadeOut.play();});

		fadeOut.setOnFinished((e)->{
			try {
				AnchorPane parentContent = FXMLLoader.load(getClass().getResource(("Menu.fxml")));
				rootAP.getChildren().setAll(parentContent );

				FadeTransition fadeIn2 = new FadeTransition(Duration.seconds(3),parentContent);
				fadeIn2.setFromValue(0);
				fadeIn2.setToValue(1);
				fadeIn2.setCycleCount(1);
				fadeIn2.play();

			} catch (IOException e1) {
				// TODO Auto-generated catch block
				e1.printStackTrace();
			}
		});
	} catch (IOException e) {
		// TODO Auto-generated catch block
		e.printStackTrace();
	}

  }

}