Probleme avec la commande source
dihia
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dihia -
dihia -
Bonjour,
pour l'installation du logiciel freesurfer j'ai besoin d'exécuter les deux commandes :
setenv FREESURFER_HOME usr/local/freesurfer
source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.csh
hors qu'il m'affiche un message d'erreur pour la deuxieme me disant que le fichier SetUpFreeSurfer.csh n'existe pas alors que il existe dans le freesurfer.
merci de m'envoyer vos réponses .
<config>Linux Firefox 3.6.10</config>
pour l'installation du logiciel freesurfer j'ai besoin d'exécuter les deux commandes :
setenv FREESURFER_HOME usr/local/freesurfer
source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.csh
hors qu'il m'affiche un message d'erreur pour la deuxieme me disant que le fichier SetUpFreeSurfer.csh n'existe pas alors que il existe dans le freesurfer.
merci de m'envoyer vos réponses .
<config>Linux Firefox 3.6.10</config>
26 réponses
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Salut
As tu vérifier les droits sur le fichier?
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salut,
merci pour votre réponse.
oui j'ai vérifié en éxécutant la commande ls -l -t voilà ce qu'il m'affiche:
-rwxr-xr-x 1 root root 1394 2011-12-30 14:48 SetUpFreeSurfer.csh -
Salut,
setenv FREESURFER_HOME usr/local/freesurfer
Il ne manque pas un slash devant ?
setenv FREESURFER_HOME /usr/local/freesurfer
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@Xavstarblues: j'ai éxécuté la commande et voilà ce qu'elle me renvoi :
/root> chmod 777 SetUpFreeSurfer.csh
chmod: ne peut accéder 'SetUpFreeSurfer.csh': Permission non accordée
@zip31: je ne sais pas, j'ai copié la commande du site du freesurfer et dans touts les site elle est écrite ainsi. -
Vous n’avez pas trouvé la réponse que vous recherchez ?
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il y a ça comme site: http://biowulf.nih.gov/apps/freesurfer.html
je n'arrive pas à accéder au site du freesurferwiki pour vous donner le lien-
bash shell: export FREESURFER_HOME=/usr/local/freesurfer source $FREESURFER_HOME//SetUpFreeSurfer.sh csh/tcsh shell: setenv FREESURFER_HOME /usr/local/freesurfer source $FREESURFER_HOME//SetUpFreeSurfer.csh
Que ce soit en bash ou en csh, les 2 ont le slash (la racine du système) en début de chemin ;-((
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et maintenant il m'affiche cette erreur :
% source $FREESURFER_HOME//SetUpFreeSurfer.csh
/usr/local/freesurfer/SetUpFreeSurfer.csh: Too many open files. -
hello
que répond la commandelimit descriptors
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-
que répond la commande
limit
-
% limit
cputime unlimited
filesize unlimited
datasize unlimited
stacksize 8192 kbytes
coredumpsize 0 kbytes
memoryuse unlimited
memorylocked 64 kbytes
maxproc unlimited
openfiles 1024 -
essayer en root
limit openfiles 2048
-
quand j'exécute la commande limit en root ça donne ça:
/root> limit
cputime unlimited
filesize unlimited
datasize unlimited
stacksize 8192 kbytes
coredumpsize 0 kbytes
memoryuse unlimited
vmemoryuse unlimited
descriptors 1024
memorylocked 64 kbytes
maxproc unlimited
et quand j'execute la commande : limit openfiles 2048
le résultat: no such limit -
essaye en root
limit descriptors 2048
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en root ?
~/tmp/a# limit descriptors descriptors 1024 ~/tmp/a# limit descriptors 2048 ~/tmp/a# limit descriptors descriptors 2048 ~/tmp/a#
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:/root> descriptors 1024
descriptors: Command not found.
nassima:/root> limit descriptors
descriptors 1024
:/root> limit descriptors 2048
limit: descriptors: Can't set limit (Opération non permise) -
quelle est la limite ?
limit -h
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bonjour,
c bon la commande limit descriptors 2048 a marché, mais à l'exécution de la commande : source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.csh j'ai toujours la meme erreur too many open files -
et en bash ?
bash export FREESURFER_HOME=/usr/local/freesurfer source $FREESURFER_HOME//SetUpFreeSurfer.sh
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merci ça a marché, mais j'ai un autre souci si vous pouvez m'aider car je dois maintenant exécuter la commande qdec
il m'affiche cette erreur :
/usr/local/freesurfer/bin/qdec.bin: Erreur de format pour exec(). Binary file not executable.
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