Retenue de garantie dans ebp

Bonjour,
je suis secrétaire dans une entreprise de bâtiment qui utilise ebp devis et facturation.
Problème : une retenue de garantie est imputable sur le net à payer dans certain cas mais celle ci n'est absolument pas prévue dans le logiciel. Comment me débrouiller pour que mes factures soient justes alors que la formule du net à payer n'est pas transformable ?
Merci d'avance en espérant que quelqu'un puisse m'aiguiller