Erreur à l'ouverture du terminal

Fermé
Meve - Modifié le 20 sept. 2021 à 15:12
mamiemando Messages postés 33346 Date d'inscription jeudi 12 mai 2005 Statut Modérateur Dernière intervention 8 novembre 2024 - 20 sept. 2021 à 15:17
Bonjour,

Mon post est potentiellement dans la mauvaise catégorie, je m'en excuse si c'est le cas.

Quand j'ouvre mon terminal (Gnome 3.36.2), il y a un message d'erreur que j'aimerais comprendre:

-------- freesurfer-linux-centos8_x86_64-7.2.0-20210720-aa8f76b --------
Setting up environment for FreeSurfer/FS-FAST (and FSL)
FREESURFER_HOME /usr/local/freesurfer
FSFAST_HOME /usr/local/freesurfer/fsfast
FSF_OUTPUT_FORMAT nii.gz
SUBJECTS_DIR /usr/local/freesurfer/subjects
MNI_DIR /usr/local/freesurfer/mni
FSL_DIR /usr/share/fsl/5.0
bash: fg: no job control
bash: /home/expe/.bashrc: line 27: syntax error near unexpected token `('
bash: /home/expe/.bashrc: line 27: `spm_path = getenv('SPM_PATH');'


Les lignes du .bashrc auxquelles me renvoient le message d'erreur me semblent pourtant correctes en termes de syntaxe :

%-SPM12-
spm_path = getenv('SPM_PATH');
if spm_path,
addpath(spm_path);


Une idée de ce qui pourrait poser problème ici ?

1 réponse

mamiemando Messages postés 33346 Date d'inscription jeudi 12 mai 2005 Statut Modérateur Dernière intervention 8 novembre 2024 7 803
20 sept. 2021 à 15:17
Bonjour

Ceci :
%-SPM12-
spm_path = getenv('SPM_PATH');
if spm_path,
addpath(spm_path);

... n'est pas conforme à la syntaxe du langage bash, donc ça ne me choque pas que bash ne comprenne pas ce que tu veux faire.
  • Pour récupérer le contenu de la variable on utilise l'opérateur
    $
    , par exemple
    $SPM_PATH
    .
  • Les appels de fonctions ne comportent pas de parenthèse en shell.
  • Un
    if
    ne s'écrit pas comme ça (voir par exemple ce cours).
  • La fonction
    addpath
    n'existe pas il faudrait la définir et en pratique c'est inutile. Par exemple pour ajouter
    /home/bin
    à la variable
    PATH
    (qui liste des chemins séparés par
    :
    ) on écrirait
    PATH="$PATH:/home/bin"
    .


Bonne chance
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