VLC incruster sous-titres arabes

Bonjour, voilà ça fait maintenant 1 semaine que je cherche une solution à mon problème en vain.
Je vous dis tout: j'ai un film en .flv et son fichier de sous-titres en .srt tout marche nickel sur Vlc. Mais je veux couper une scène au milieu du film, ce que j'arrive à faire aisément avec FreeVideoDub, mais bien-sûr les sous-titres ne suivent pas c'est pour cela que je veux incruster d'abord les sous-titres dans la vidéo et couper la scène ensuite. J'ai essayé avec de nombreux logiciels (format factory, avi recomp etc..) mais à la fin de la "fusion", quand je lance le film, les sous-titres sont illisibles!! Alors que quand je lances le film sur vlc avec mes deux fichiers distincts ça marche très bien malgré le fait que dans le fichier de sous titres (que j'ouvre avec le bloc-note) les sous-titres soient illisibles aussi...
J'ai aussi essayé de changer l'encodage mais rien n'y fait, je suis au bout de ma vie...(j'exagère un peu mais quand même)
Bon, merci d'avance pour votre aide.