"java.lang.NullPointer.Exception[Non resolu]

voila je dois lire un texte , recuperer 1 ligne sur 2 du texte en un tableau de caractere.
J'essaye de récupere tout le texte dans un tableau de caractère puis copier une ligne sur 2 tableau dans un autre tableau qui sera mon tableau final
le probleme les lignes n'ont pas toutes la meme taille , mais les ligne que je veux retenir elles ont la même taille
du coup je me retrouve avec l'erreur, je pense qu'elle du fait des difference des tailles de ligne
A l'aide

char [][] tab = new char [11286][]; // tableau dans lequel on veut stocker le texte caractère par car de chaque ligne
char [][] tab2 = new char[5632][48]; // tableau dans lequel on veut stocker nos proteines
try{

BufferedReader br=new BufferedReader(En);
while ((ligne=br.readLine())!=null){
if(ligne.toCharArray().length!=48){
car = (48-ligne.toCharArray().length);
for(j=0;j<11286;j++){
for(k=0;k<48;k++){
tab[k][j]=ligne.toCharArray()[j];
char [] tab3 = new char[car];
}}
}


}


br.close();
}
catch (Exception e){
System.out.println(e.toString());
}