Permuter les disques durs sans erreurs de Boot.ini : Faisable ?

Bonjour
La question peut etre étrange mais avant de faire les expériences, si je parviens a obtenir une réponse ici, cela me fera gagner du temps.

Je suis confronté a un problème au boulot : Je dois utiliser différents logiciels et matériel usb, dont certains ne fonctionne que sur windows 32, d'autre sur 64, certain sur windows 7, d'autres windows xp, 10 etc. (problème de drivers si architecture/OS non adaptés)

Afin de ne pénaliser aucun logiciel en cas de panne d'un autre, je les ai séparé chacun son OS. Session individuel. Une panne n'impacte pas les autres.
(Chaque programme que j'utilise en cas d'anomalie demande une réinstallation complète et propre sur OS reformaté donc je suis obligé de les séparés pour ne pas réinstallé l'ensemble des programmes/os)

Les nouvelles architectures ne permettent plus l'usage d'XP, je me retrouves donc a avoir un PC pour du X64 et l'autre pour du X32 et XP. La machine pour le x32 ne permet pas plus de 5 partitions primaire (limitation MBR) pour les OS donc je dois faire des disques virtuels et j'obtiens régulièrement des bug de boot.ini et ca devient vite le foutoir.

J'ai en tout une vingtaine de sessions différentes.(X32 & X64 compris)


Ma question est la suivante :
Si je prend ma machine compatible X32, que j'y installe un OS et son logiciel, que je débranche le disque dur, que j'en plug un autre et que j'y fais une install OS X64 (qui est compatible aussi, les nouvelles archi ne sont pas rétrocompatible mais les anciennes fonctionnent en x32 & x64), puis-je alterner ainsi en ayant qu'un disque branché sans avoir de problème de boot ini ou autres ?

De la même manière que vous imagineriez une machine a cartouches. J'ai besoin de ma cartouche pour tel programme, je la branche.
Idéalement j'imagine une station de travail fixe et un dock externe de disque dur 2.5" et un tiroir avec des disques dur rangés dans des boites. et un disque 4to avec les backups virtualisé de chacun.

Merci pour votre aide