Remplissage de matrice 3D coupe par coupe Fermé

Question

Bonjour, 

J'ai écrit quelques lignes de code permettant de séparer les différentes partie d'une jambe en fonction de leur niveau de gris sur une coupe IRM.

J'aimerais créer une matrice 3D et la remplir pour faire un nuage de point représentant par exemple le muscle en 3D, mais je n'ai jamais appris ça en cours et je ne trouve d'aide nulle part.

J'ai creer une matrice zeros(73,512,512), 73 étant le nombre d'images disponibles et 512*512 leur résolution, et j'aimerais écrire quelque chose comme zeros(h,i,j)=(h,muscle(i),muscle(j)) mais je sais que c'est faux, je n'ai juste pas la moindre idée de la syntaxe correcte et il me semble que c'est un non-sens de mettre le h deux fois.

Bref, merci à ceux qui voudront bien m'aider

Antoine



Configuration: Windows 7 / Firefox 20.0

artmagniac · Answer

Bonjour, si j'ai bien compris t'as 73 images de 512*512 éléments et tu veux transformer ça en 3D? Mais que sont ces 512 éléments? des pixels? des valeurs? quel types de donnés?

et qu'est-ce que tu appelles muscle(i)?

quoiqu'il en soit je crois que tu vas devoir passer par une boucle du style :

for i=1:73
   for j=1:512
      for k=1:512
         M(j,k,i)= quelquechose qui vient remplir ta matrice avec tes "images" de muslce... y aura ptêtre un "load" a faire avant... sous quel format sont tes images une fois que t'as séparé en niveau de gris?
pourais tu éventuellement envoyer une de ces images en lien? 
      end
   end
end

antoinantoine · Answer

Bonjour,

Merci beaucoup pour ton aide

Les images sortent en binaire, comme ici : http://tinypic.com/images/goodbye.jpg

J'ai fait une triple boucle comme tu m'as indiqué, et j'obtiens bien une matrice 73*512*512 pour chaque tissu à la fin, mais je n'arrive pas à l'afficher, que ce soit avec surf ou scatter3...

antoinantoine · Answer

Bonjour,

Merci beaucoup pour ton aide

Les images sortent en binaire, comme ici : http://tinypic.com/images/goodbye.jpg

J'ai fait une triple boucle comme tu m'as indiqué, et j'obtiens bien une matrice 73*512*512 pour chaque tissu à la fin, mais je n'arrive pas à l'afficher, que ce soit avec surf ou scatter3...

artmagniac · Answer

ce que tu peux vérifier déjà pour voir si ta matrice est bonne c'est surf(1:512,1:512,M(:,:,10)) par exemple et tu devrais retrouver la surface de la 10ème image....

pour ce qui est du dessin 3D j'avoue avoir des lacunes dans ce domaine, je pense malheureusement que matlab n'est pas cabable d'en faire en volume, mais plutot de la 3D de surface...

antoinantoine · Answer

Au final, j'ai créé deux programmes différents, un qui gère la segmentation et crée par exemple muscle(i).gif pour i allant de 1 au nombre de séquences initiales, puis je tente un autre programme qui rentre tout ça dans un fichier excel pour le lire après. Je comprends pas tout ce que je fais mais le premier programme marchant parfaitement, je pense que je me lance vers quelque chose

artmagniac · Answer

ok désolé de pas pouvoir t'aider plus!

antoinantoine · Answer

Pas de problème ! C'est déjà super gentil d'avoir essayé, merci !

Remplissage de matrice 3D coupe par coupe

7 réponses

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