Disques durs maître et esclave

Bonjour,
J'ai un disque C en maître et un disque E en esclave. Sur les 2 disques durs, les cavaliers sont en position Cable Select et c'est par la bande électrique que les branchements sont réalisés : noir pour le maître et gris pour l'esclave.
Les 2 disques sont bien reconnus par l'ordi et je peux travailler sur les 2.
Quand j'ai installé le disque E, Windows a demandé une vérification du système fichier pour prouver son intégrité.
Aux démarrages suivants, il la demande 1 fois sur 3.
Pourquoi demande-t-il cette vérification et quoi faire pour qu'il ne la fasse plus ?

p.s. : le disque E était mon ancien maître. Je l'ai mis en esclave car il a bugué. J'ai réussi à le débloquer grâce à file recovery et easy recovery et j'ai donc toutes mes données.
Merci !