Dossier vide sur disque dur externe alors qu'il ne l'est pas

Bonjour,

J'ai un soucis avec mon disque dur externe, quand je clique sur mon dossier principal (341 Go) "le dossier est vide" s'affiche.
Résumé de la situation : J'avais sur mon ordi Windows Vista ET Ubuntu. Je pouvais lire mon disque dur sur les 2 systèmes sans problème. Jusqu'au jour où, en faisant des sauvegardes, je me suis aperçu que le dossier apparaissait vide sous windows (mais pas sous ubuntu!). Les fichiers du dossier sont bien toujours présents, le disque dur fait toujours la même taille. J'ai oublié ce problème ... et j'ai fait un petit changement sur mon ordi : suppression de windows vista et d'ubuntu pour y installer windows 7. Problème : le dossier principal de mon disque dur s'affiche toujours comme étant vide sous windows 7.
(J'ai fait une analyse du disque avec avast, pas de problème détecté.)

J'ai fait un scan avec RogueKiller, et voilà ce qu'il en ressort (2 fichiers détectés dont un en rouge) :

RogueKiller V10.10.7.0 [Sep 28 2015] par Adlice Software
email : http://www.adlice.com/contact/
Remontées : http://forum.adlice.com
Site web : http://www.adlice.com/fr/logiciels/roguekiller/
Blog : http://www.adlice.com

Système d'exploitation : Windows 7 (6.1.7601 Service Pack 1) 32 bits version
Démarré en : Mode normal
Utilisateur : Agathe [Administrateur]
Démarré depuis : C:\Users\Agathe\Desktop\RogueKiller.exe
Mode : Scan -- Date : 10/03/2015 17:07:43

¤¤¤ Processus : 0 ¤¤¤

¤¤¤ Registre : 2 ¤¤¤
[Hj.RegVal] HKEY_LOCAL_MACHINE\RK_Software_ON_D_31A9\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\Winlogon | Shell : cmd.exe /k start cmd.exe -> Trouvé(e)
[PUM.StartMenu] HKEY_USERS\S-1-5-21-4233905453-2871850728-3176140676-1000\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\Advanced | Start_ShowMyGames : 0 -> Trouvé(e)

¤¤¤ Tâches : 0 ¤¤¤

¤¤¤ Fichiers : 0 ¤¤¤

¤¤¤ Fichier Hosts : 0 ¤¤¤

¤¤¤ Antirootkit : 0 (Driver: Chargé) ¤¤¤

¤¤¤ Navigateurs web : 0 ¤¤¤

¤¤¤ Vérification MBR : ¤¤¤
+++++ PhysicalDrive0: FUJITSU MHW2160BH ATA Device +++++
--- User ---
[MBR] 8b1c4b33467e465dd4cdce53f372e403
[BSP] 4b59f11fc371874d53edb2cda998bf92 : Windows Vista/7/8 MBR Code
Partition table:
0 - [XXXXXX] DELL-UTIL (0xde) [VISIBLE] Offset (sectors): 63 | Size: 109 MB
1 - [XXXXXX] NTFS (0x7) [VISIBLE] Offset (sectors): 225280 | Size: 10240 MB [Windows Vista/7/8 Bootstrap | Windows Vista/7/8 Bootloader]
2 - [ACTIVE] NTFS (0x7) [VISIBLE] Offset (sectors): 21196800 | Size: 74422 MB [Windows Vista/7/8 Bootstrap | Windows Vista/7/8 Bootloader]
3 - [XXXXXX] EXTEN-LBA (0xf) [VISIBLE] Offset (sectors): 173614455 | Size: 67852 MB
User = LL1 ... OK
User = LL2 ... OK




Pouvez-vous m'aider S'IL VOUS PLAIT ?
Je ne sais pas quoi faire... Il y a toute une partie de ma vie sur ce fameux dossier.... !

Merci d'avance.

Agathe