Ckeditor et balise php

Bonjour,

Je suis en train de me faire un petit site et pour facilité l'édition des fichier de contenu j'ai installé ckeditor, je fais un $contenu = file_get_contents($fichier);
pour afficher le fichier dans un textarea et pour pouvoir le modifier avec ckeditor.

Le problème est que j'ai une balise <?php ?> en début de chaque fichiers de contenu qui me permet de changer les title de chaque pages et ces balises son mal interprété par ckeditor, quand je sauvegarde il me convertie les balises php en code iso html.

Seriez-vous comment je peut faire pour contourner ce problème?