Cryptages de données ss ubuntu et winchoze

Bonjour,
j'essaye de mettrre en place d'un système de chiffrement et de dechiffrement au vol sous Linux et Windows en fait voila le réel titrre de mon stage et j'ai bcp de lacune sous linux !!en fait le laboratoire ou je suis me demandait a la base d'utiliser un logiciel nommer FreeOTFE afin de permettre aux utilisateurs de protéger les données stockées dans les ordinateurs, le problème étant que ce logiciel n'existant pas sous linux, nous avons essayer de le faire fonctionner a l'aide de wine qui ne permet pas l'installation de celui ci. NJotre but étant de sécuriser des information il nous faudrait créer une partition chiffrée qui permettrai aux utilisateur d'y déposer des fichiers qui se crypteront automatiquement que ce soit a l'aide d'un cryptage blowfish twofish ou encore un autre. le problème étant aussi que certaines machine fonctionnent sous windows et d'autre linux.