Risques des transferts FTP?

Salut!

J'aimerais savoir si le fait de transférer des fichiers sur un serveur distant via un client FTP représentait des risques pour les fichiers locaux (de ma propre machine et non du serveur)? Par exemple, quand on se connecte via FTP à un serveur, est-ce que le propriétaire de ce serveur peut bidouiller avec les fichiers de mon ordinateur (du moins ceux qui sont dans le dossier ouvert dans le navigateur FTP de mon côté)?

Si oui, est-ce qu'en protégeant les dossiers parents ou sous-dossiers par des mots de passe il y aurait moyen d'éviter que quelqu'un bidouille avec mes données à distance?

J'ai beau chercher des infos là-dessus dans Google, rien n'est pertinent.
Merci si vous pouvez éclairer ma lanterne.