Programme sur les séquences de DNA, RNA, ect.

Bonjour,
Pour mon cours de programmation(niveau débutant) je dois créer un programme sous eclipse dont l'objectif est de pouvoir insérer une séquence de DNA, RNA ou de protéines et par la suite pouvoir obtenir; la taille de la séquence, la transcription(DNA=>RNA), la traduction(DNA=>protéines), la plus grande protéines de la séquence, etc.
Mais avant tout il faut pouvoir l'a lire et valider la séquence(vérifier s'il s'agit bien d'une séquence sur laquelle on peut effectuer ce que l'on prétend).
La vérité c'est que je ne sais pas par où commencer..
Bah premièrement, j'ai décidé que pour insérer une séquence, le programme doit aller la chercher(elle doit être dans un bloc de notes). J'ai déjà fait cette action-là. Mais comment l'a lire? L'a valider? L'imprimer(elle doit apparaitre dans une aire de texte dans le programme)? Pour après pouvoir créer les autres actions..
Merci beaucoup