Encore et Encore un retour de chariot en sed

Résolu/Fermé
DidierZ - 24 août 2011 à 14:31
zipe31 Messages postés 36402 Date d'inscription dimanche 7 novembre 2010 Statut Contributeur Dernière intervention 27 janvier 2021 - 24 août 2011 à 16:15
Bonjour,

j'ai beau chercher dans les forums et bien que cela est déjà été traité, je n'arrive a rajouter un retour chariot ou une fin de ligne dans mon script (les \n ou \r ne marche pas. J'utilise MacOS 10.6 et le terminal shell)
merci d'avance
Didier

2 réponses

zipe31 Messages postés 36402 Date d'inscription dimanche 7 novembre 2010 Statut Contributeur Dernière intervention 27 janvier 2021 6 417
24 août 2011 à 14:41
Salut,

Montres-nous ce que tu veux faire exactemet et comment tu t'y prends.
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je rajoute un ligne a mon fichier
voici mon script:
for fich in *.gb; do sed -e '1 s/^/<a href="'${fich%.gb}.fas'">FASTA<\/a>\r/' "$fich" > "DZ$fich"; rm "$fich"; mv "DZ$fich" "$fich"; done
Didier
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petite précision: peu importe le fichier texte qui est contenu avant mais pour info voici comment se présente un des fichiers (je veux tous les modifier ... il y a a plus de 100000)

LOCUS Locus_1000_Trans 292 bp DNA linear UNA 21-JUL-2011
DEFINITION transcripts_v2_6389.
ACCESSION
VERSION
KEYWORDS .
SOURCE .
ORGANISM
.
FEATURES Location/Qualifiers
ORIGIN
1 aggcaagttc tgggtctggt attccacatg ttgcttttag aatatcattg aaaacatctg
61 gctccatttg tttaggcatt ctatgcttca gttggactcc cttacaaaac tcccttgcag
121 catcaacaat gtctcccttt ccatcctgct cagacagcaa gctgatacac acttgtgttg
181 gtgcaaggat ctcacaatcg aatttaacgt cttttgttct cagaacaaat gtgtatttgc
241 tggattcatc tgtaaaaact tctttttgct tccgaataat ttcacttgag aa
//

et voici ce qui j'obtiens avec le script :
<a href="Locus_1000.fas">FASTA</a>rLOCUS Locus_1000_Trans 292 bp DNA linear UNA 21-JUL-2011
DEFINITION transcripts_v2_6389.
ACCESSION
VERSION
KEYWORDS .
SOURCE .
ORGANISM
.
FEATURES Location/Qualifiers
ORIGIN
1 aggcaagttc tgggtctggt attccacatg ttgcttttag aatatcattg aaaacatctg
61 gctccatttg tttaggcatt ctatgcttca gttggactcc cttacaaaac tcccttgcag
121 catcaacaat gtctcccttt ccatcctgct cagacagcaa gctgatacac acttgtgttg
181 gtgcaaggat ctcacaatcg aatttaacgt cttttgttct cagaacaaat gtgtatttgc
241 tggattcatc tgtaaaaact tctttttgct tccgaataat ttcacttgag aa
//

merci d'avance
Didier
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Je te remercie beaucoup Zipe31 : problème résolu!
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zipe31 Messages postés 36402 Date d'inscription dimanche 7 novembre 2010 Statut Contributeur Dernière intervention 27 janvier 2021 6 417
24 août 2011 à 15:57
Essaye plutôt avec l'option "i" (insertion) de sed :

$ fich=toto.gb

$ cat plop 
LOCUS Locus_1000_Trans 292 bp DNA linear UNA 21-JUL-2011
DEFINITION transcripts_v2_6389.
ACCESSION
VERSION
KEYWORDS .
SOURCE .
ORGANISM

$ sed -e '1 i\
<a href="'${fich%.gb}.fas'">FASTA</a>' plop
<a href="toto.fas">FASTA</a>
LOCUS Locus_1000_Trans 292 bp DNA linear UNA 21-JUL-2011
DEFINITION transcripts_v2_6389.
ACCESSION
VERSION
KEYWORDS .
SOURCE .
ORGANISM

$

J'ai raccourci ton fichier pour l'exemple.
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Merci beaucoup!
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zipe31 Messages postés 36402 Date d'inscription dimanche 7 novembre 2010 Statut Contributeur Dernière intervention 27 janvier 2021 6 417
24 août 2011 à 16:15
De rien ;-))
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