Encore et Encore un retour de chariot en sed

Résolu

DidierZ -
zipe31 Messages postés 34620 Date d'inscription Statut Contributeur Dernière intervention - 24 août 2011 à 16:15

Bonjour,

j'ai beau chercher dans les forums et bien que cela est déjà été traité, je n'arrive a rajouter un retour chariot ou une fin de ligne dans mon script (les \n ou \r ne marche pas. J'utilise MacOS 10.6 et le terminal shell)
merci d'avance
Didier

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zipe31 Messages postés 34620 Date d'inscription Statut Contributeur Dernière intervention 6 501

Salut,

Montres-nous ce que tu veux faire exactemet et comment tu t'y prends.
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1. DidierZ
  
  je rajoute un ligne a mon fichier
  voici mon script:
  for fich in *.gb; do sed -e '1 s/^/<a href="'${fich%.gb}.fas'">FASTA<\/a>\r/' "$fich" > "DZ$fich"; rm "$fich"; mv "DZ$fich" "$fich"; done
  Didier
  
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2. DidierZ
  
  petite précision: peu importe le fichier texte qui est contenu avant mais pour info voici comment se présente un des fichiers (je veux tous les modifier ... il y a a plus de 100000)
  
  LOCUS Locus_1000_Trans 292 bp DNA linear UNA 21-JUL-2011
  DEFINITION transcripts_v2_6389.
  ACCESSION
  VERSION
  KEYWORDS .
  SOURCE .
  ORGANISM
  .
  FEATURES Location/Qualifiers
  ORIGIN
  1 aggcaagttc tgggtctggt attccacatg ttgcttttag aatatcattg aaaacatctg
  61 gctccatttg tttaggcatt ctatgcttca gttggactcc cttacaaaac tcccttgcag
  121 catcaacaat gtctcccttt ccatcctgct cagacagcaa gctgatacac acttgtgttg
  181 gtgcaaggat ctcacaatcg aatttaacgt cttttgttct cagaacaaat gtgtatttgc
  241 tggattcatc tgtaaaaact tctttttgct tccgaataat ttcacttgag aa
  //
  
  et voici ce qui j'obtiens avec le script :
  <a href="Locus_1000.fas">FASTA</a>rLOCUS Locus_1000_Trans 292 bp DNA linear UNA 21-JUL-2011
  DEFINITION transcripts_v2_6389.
  ACCESSION
  VERSION
  KEYWORDS .
  SOURCE .
  ORGANISM
  .
  FEATURES Location/Qualifiers
  ORIGIN
  1 aggcaagttc tgggtctggt attccacatg ttgcttttag aatatcattg aaaacatctg
  61 gctccatttg tttaggcatt ctatgcttca gttggactcc cttacaaaac tcccttgcag
  121 catcaacaat gtctcccttt ccatcctgct cagacagcaa gctgatacac acttgtgttg
  181 gtgcaaggat ctcacaatcg aatttaacgt cttttgttct cagaacaaat gtgtatttgc
  241 tggattcatc tgtaaaaact tctttttgct tccgaataat ttcacttgag aa
  //
  
  merci d'avance
  Didier
  
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3. DidierZ
  
  Je te remercie beaucoup Zipe31 : problème résolu!
  
  0

zipe31 Messages postés 34620 Date d'inscription Statut Contributeur Dernière intervention 6 501

Essaye plutôt avec l'option "i" (insertion) de sed :

$ fich=toto.gb

$ cat plop 
LOCUS Locus_1000_Trans 292 bp DNA linear UNA 21-JUL-2011
DEFINITION transcripts_v2_6389.
ACCESSION
VERSION
KEYWORDS .
SOURCE .
ORGANISM

$ sed -e '1 i\
<a href="'${fich%.gb}.fas'">FASTA</a>' plop
<a href="toto.fas">FASTA</a>
LOCUS Locus_1000_Trans 292 bp DNA linear UNA 21-JUL-2011
DEFINITION transcripts_v2_6389.
ACCESSION
VERSION
KEYWORDS .
SOURCE .
ORGANISM

$

J'ai raccourci ton fichier pour l'exemple.

DidierZ

Merci beaucoup!
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zipe31 Messages postés 34620 Date d'inscription Statut Contributeur Dernière intervention 6 501

De rien ;-))
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Encore et Encore un retour de chariot en sed

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