Probleme , cast String vers int => Java

Bonsoir,
J'ai un soucis
Qui pourrait me dire comment faire pour récuperer un élément d'une ligne d'un fichier)
En clair je résume,je lis un fichier txt, dans chaque ligne je voudrais récuperer un element , seulement c un entier qui varie de 1 à 1000,si je fais

String chaine;
chaine.SubString(26,29)

ca fonctionne mais que si mon element fais 3 caracteres de long , en l'occurence si dans mon fichier l'element ne fais que 2 caracteres ou 1 seul,evidemment la chaine sera rempli avec des espaces.
Et quand je converti en int , evidemment ya erreur !
Qui pourrait m'aider et me donner une autre solution ou une astuce pour contourner le probleme.
Merci