Bash/Shell: Exécuter un programme

Bonjour tout le monde,

Voilà j'ai un problème que je ne comprend pas moi-même. J'ai un fichier nommé exec.sh contenant un script shell. Lorsque je double-clic dessus, des programmes s'exécutent afin d'analyser des fichiers. Un premier programme, écrit en C++, s'exécute et me crée deux fichiers .cvs. Ensuite, un deuxième programme, écrit en R, s'exécute et me crée un fichier pdf à partir des deux fichiers précédents. Ce fichier pdf contient 4 graphiques.

Moi, je souhaite mettre en ligne ce programme (je l'ai déjà fait pour un autre programme). Pour cela, je crée une interface web et sur l'une de mes pages php, j'exécute le fichier exec.sh à l'aide de la fonction system().

De cette façon:

system("./exec.sh");

Mon problème c'est que cela ne fonctionne pas. Le programme écrit en C++ ne s'exécute pas et donc le programme R n'ont plus. Du coup, je n'ai pas mon fichier pdf. J'ai déjà réalise ce genre d'interface avec un autre programme mais c'était le programme R qui ne s'exécutais pas. Du coup, on m'a conseillé d'importer une library R dans mon script shell.

De cette façon:

export DYLD_LIBRARY_PATH=/Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib/x86_64/libR.dylib:DYLD_LIBRARY_PATH

De cette façon, mon programme s'exécute parfaitement. Du coup, j'ai fait la même chose pour ce nouveau programme. Mais bon, cette fois le problème vient de C++.

Du coup, je me demandais si je devais pas importer un library de ce genre mais pour c++? Sinon, je ne voit pas d'où peut provenir le problème.

Le truc c'est que mon programme c++ s'exécute parfaitement lorsque l'on double clic sur exec.sh. Et je ne sais pas pourquoi mais avec la fonction system() il ne s'exécute pas. Le problème ne vient pas de la fonction system() j'ai fait plusieurs test.
Du coup, le problème doit venir du php et de shell, mais à part la library je n'ai aucune idée d'ou le problème peut venir. Est-ce qu'il existe une library au moins ?

Quelqu'un peut m'aider ou me donner son avis s'il vous plait !

Merci d'avance.

Voici mon script shell, exec.sh, si sa peut aider:

cd /Users/nom/programme/
echo "" > chrono.txt
echo "" > reflex.txt
ls /Volumes/Data/RawData | grep dat | cut -d"." -f1 >> reflex.txt
 
acc=0
k=0
for j in 'cat reflex.txt'; do
    echo "$j" | ./traitement&
    k=$(($k+1))
    acc=$(($acc+1))
    if [ $k = 1 ]; then
                k=0
        wait
    fi
done
wait
 
export DYLD_LIBRARY_PATH=/Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib/x86_64/libR.dylib:DYLD_LIBRARY_PATH
R CMD BATCH --vanilla /Users/nom/programme/src/Graphique.R log.txt
 
path='pwd'
cd /Volumes/Data/Output
zip $path\/outputs.zip OutputR/*.csv OutputCherryPick/*.csv OutputPdf/*.pdf
cd $pwd
rm /Volumes/Data/Output/OutputR/*.csv /Volumes/Data/Output/OutputCherryPick/*.csv /Volumes/Data/Output/OutputPdf/*.pdf