Sécuriser des accès à mon serveur web

Bonjour,
J'ai un site web professionnel géré par 2 prestataires : un hébergeur et une agence de développement de sites web.

Les codes sources de mon site a été détruits il y a 4 jours par un hacker ("wong spidernet").L'hébergeur qui est censé assurer la sécurisation de mon serveur nie toute responsabilité quant à la sécurisation des accès via NNC et FTp ouverts pour les mises en ligne par l'autre prestataire ... Ma question : l'un(e) d'entre vous connait-il(elle) une solution de sécurisation de ces accès ?

Merci par avance de vos réponses et de votre aide.
Cdlt,
Anne Isabelle