Disque dur externe

Bonjour,
Mon laptop ACER sous Winsdows Vista a été infecté par le virus trojan, après sauvegarde/récupération des données sur DDI j'ai du faire réinstaller on m'a conseillé Windows 7+ pilotes. J'avais enregistré mes données sur un DDE WDigital. Je voudrais réinstaller mes nouveaux dossiers. Que se passe-t-il lorsque les certains dossiers sont différents je suppose qu'on ne peut pas annuler les anciers et transférer les nouveaux (je ne suis pas une flèche en informatique vous l'aurez deviné...). Si la réponse est non que me conseillez-vous de faire ? ex. dans Windows Vista la personne qui avait installé le système avait ouvert un dossier sauvegarde sans me dire que dans ce dossier figuraient les anciens dossiers du précédent ordinateur de façon à ce que je vérifie ce qui devait être effacé définitivement. Je les avais gardés il se trouve donc à ce jour dans le DDE je voudrais l'effacer. ainsi que d'autres afin de faire de la place sur le DDE. Merci d'avance.