Joindre ou concaténer horizontalement plusieu

jil -  
Salut

je cherche à joindre plusieurs fichiers de manière horizontale et la commande : 

join *.asc > all.txt


ne fonctionne pas.

J'ai une trentaine de fichiers.
La première colonne de ces fichiers contient toujours la même chose, dans tous les fichiers.
Exemple :
fichier1.asc
1 ee
2 rr
3 4a
...

fichier28.asc
1 oa
2 0p
3 8ue
...

etc...
et j'aimerai avoir :

all.txt :

1 ee ... ... ... ... oa ...
2 rr ... ... ... ... 0p ...
3 4a ... ... ... ... 8ue ...
etc.

Merci d'avace !

7 réponses

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  1. jil
    Salut.

    Ok alors ;

    @zipe : paste -d '|' *.asc | sed 's/|[^\t]*\t/\t/g' > new_fichier.txt
    ça marche pas très bien. Le résultat est concluant, mais j'ai deux trois endroits dans le fichier final qui comporte des trous, des décalages, et le dernier caractère du fichier est un pipe.

    @dubcek : $ ls *.asc | awk '{x="|join - "} NR<2{x="cat "} {printf x $1}' | sh

    ça ça marche admirablement bien.
    Je me demande pourquoi c'est si compliqué pour faire une chose si simple mais bon... tant que "quelque chose" fonctionne... ;)
    Faudrait aussi voir ce qui bug avec la formule de zipe , je reste persuadé qu'on peut en faire quelque chose.

    Cdlt et bonne soirée.
    1. dubcek Contributeur
      le problème,c'est que join n'accepte que 2 fichiers en entrée et donc il faut bricoler
      on peut encore simplifier avec join: 
      ls *.asc | awk -v s="cat " '{printf s $1 ; s=" | join - "} | sh
    2.  zipe31 Contributeur
      Il faudrait voir le contenu du fichier en entier. Peut être y-a-t-il des caractères (non-imprimable) que l'on ne voit pas et qui mettent le bronx ;-\
  2. zipe31 Contributeur
    Salut,

    Tes fichiers ont tous le même nombre de lignes et exactement la même valeur commune en début de ligne ?

    Les espace entre chaque valeur sont-il toujours les mêmes (espace simple) ? Ou diffèrent-ils ?
    1. jil
      Même nombre de lignes pour tous.

      Même première "colonne", sparée de la deuxième par tabulation.

      C'est vraiment simple. Mais je n'y arrive pas.

      ;) merci pour ta répose déjà...
      1. dubcek Contributeur
        hello 
        $ head a1 a2
==> a1 <==
1 ee ...
2 rr ...
3 4a ...

==> a2 <==
1 oa ...
2 0p ...
3 8ue ...
$ 
$ awk '{n=$1 ; $1="" ; x[n]=x[n] $0} END {for(n in x) print n, x[n]}' a1 a2
1  ee ... oa ...
2  rr ... 0p ...
3  4a ... 8ue ...
$
        1. zipe31 Contributeur
          Perso j'avais : 

          $ head f* 
==> f1 <== 
1 ee bla bla 
2 rr bli bli 
3 4a blu blu 

==> f2 <== 
1 oa gla gla 
2 0p gli gli 
3 8ue glu glu 

==> f3 <== 
1 bb pla pla 
2 0m pli pli 
3 5f1 flu flu 

$ paste -d '|' f* | sed 's/|[^ ]*//g'
1 ee bla bla oa gla gla bb pla pla
2 rr bli bli 0p gli gli 0m pli pli
3 4a blu blu 8ue glu glu 5f1 flu flu

$

          ;-))
        2. gm
          Et moi je partais sur un join, mais bon je ne vais pas chercher la ligne exacte du coup :)
        3. zipe31 Contributeur
          Ben le "join" ne marche que sur 2 fichiers et à moins de se lancer dans une boucle... ;-\
        4. jil
          exact ; "join" c'est pour deux fichiers que ça va bien...

          Pour le reste, ta commande 'paste' ne crèe pas un nouveau fichier zipe ?!
          j'ai essayé, et rien. il faudrait que ça puisse créer un nouveau fichier avec tous les petits fichiers concaténés horizontalement.

          Et le problème, ce sont les noms de fichiers qui sont longs et pas très homogènes ; excepté l'extension : *.asc : th0293d24.asc par exemple.
        5. zipe31 Contributeur
          Suffit de rajouter une redirection ;-\ 

          paste -d '|' f* | sed 's/|[^ ]*//g' > new_fichier
      3. jil
        Re salut. Merci. J'y ai pas pensé :/ .

        Alors : 

        paste -d '|' *.asc | sed 's/|[^ ]*//g' > new_fichier.txt


        mais ça ne fonctionne pas. Enfin, il y a deux problèmes :
        1. que deux colonnes.
        2. que le premier fichier y est présent.
        1. zipe31 Contributeur
          On peut avoir un aperçu du contenu de tes fichiers avec mise en forme respectée (espaces, tabulations, etc.) ?

          As-tu essayé la solution de dubcek ?
        2. jil
          700.000000 0.000980
          699.800000 0.000993
          699.600000 0.001009
          699.400000 0.001026
          699.200000 0.001042
          699.000000 0.001051
          698.800000 0.001051
          698.600000 0.001045
          698.400000 0.001038
          698.200000 0.001032
          698.000000 0.001024
          697.800000 0.001015
          697.600000 0.001007
          ....

          chaque fichier contient la même première colone et la sépration entre les deux colonnes sont des tabulations.

          je suis entrain d'essayer de comprendre la solution de dubcek mais j'ai pas très envie d'entrer à la main le nom des trente fichiers à concaténer ... surtout qu'ils sont longs ces noms.
        3. zipe31 Contributeur
          mais j'ai pas très envie d'entrer à la main le nom des trente fichiers à concaténer
          Tu peux user du "*" à la place ;-))
        4. dubcek Contributeur
          tout à fait
        5. zipe31 Contributeur
          Sinon essaye avec : 

           paste -d '|' *.asc  | sed 's/|[^\t]*\t/\t/g' > new_fichier.txt
      4. jil
        Comme ceci par exemple ? :
        awk '{n=$1 ; $1="" ; x[n]=x[n] $0} END {for(n in x) print n, x[n]}' ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^
        1. dubcek Contributeur
          non 
          awk ... *.asc
      5.  dubcek Contributeur
        essayer avec join 
        $ ls *.asc | awk '{x="|join - "} NR<2{x="cat "} {printf x $1}' | sh
        1.  zipe31 Contributeur
          Waouw, ça c'est fort en chocolat ;-))

          Mais tu pourrais traduire s'teuplé ?
          Mon cerval sedéen a du mal à capter toutes les subtilités ;-\

          Merchi ;-))
        2. dubcek Contributeur
          comme join n'accepte que 2 fichiers, je construis une enfilade de commandes de join successifs , donc je joins a1 et a2, puis le résultat avec a3, etc 
          $ ls a* 
a1  a2 a3  a4 
$  
$ ls a* | awk '{x="|join - "} NR<2{x="cat "} {printf x $1}' 
cat a1|join - a2|join - a3|join - a4$  
$
          j'ai essayé, mais pas pu : join fichier <(un truc récursif de join avec les autres fichiers)
        3. zipe31 Contributeur
          Ok merci beaucoup ;-))

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