Meilleur conversion vidéo

Bonjour,
J'ai télechargé des vidéos en .flv sur internet que j'aimerais réutiliser pour faire un montage vidéo. Mais le logiciel que je veux utiliser (Final Cut Express) ne reconnait pas la vidéo en .flv
Je dois donc changer le format de ma vidéo donc je voudrais savoir quel est le "meilleur" format pour ne pas perdre la qualité de la vidéo? Et par quel moyen je peux arriver à convertir ma vidéo dans ce format?

Merci d'avance!