Extraction de colonnes

sky -  
dubcek Messages postés 19021 Statut Contributeur -
Bonjour,

Dans un fichier j'ai un tableau de 100000 colonnes et 800 lignes. Je voudrai extraire de ce fichier 500 colonnes. Les numéros des colonnes à extraire sont mises dans un autre fichier.
J'ai essayé plusieurs commande avec sed, ou encore awk mais je n'y suis pas arrivée.
Est ce que vous savez s'il est possible de faire cela avec le terminal de linux?

Je vous remercie par avance.

3 réponses

Réponse 1 / 3
dubcek Messages postés 19021 Statut Contributeur 5 639
 
hello
soit le fichier num qui contient les N° de colonnes à afficher, 1 par ligne et le fichier fic qui contient les 100000 colonnes: 
$ awk 'BEGIN{while("cat num"|getline)x[n++]=$1} ; {for(i=0;i<n;i++)printf $x[i] OFS; print ""}' fic > resultat
0
Réponse 2 / 3
sky
 
salut,

merci beaucoup pour ta réponse. J'ai essayé ton code mais il me dit qu'il y a une erreur avec awk: program limit exceeded : maximum number of field = 32767.

Je pense que c'est donc les 100000 colonnes qu'il n'apprécie pas...

est ce qu'il existe une autre méthode??

Merci encore.
0
dubcek Messages postés 19021 Statut Contributeur 5 639
 
effectivement, awk est limité à 32K champs, utilise gawk à la place 
$ seq -s " " 1 200000 > a
$ gawk -v c=40001 -v c2=100002 -v c3=199998 '{print NF, $c, $c2, $c3}' a
200000 40001 100002 199998
$
0
Réponse 3 / 3
lami20j Messages postés 21644 Statut Modérateur, Contributeur sécurité 3 570
 
Salut,

Essaie comme ça 
~ $ cat num
2
3

~ $ cat colonne.txt
nom prenom age sexe
AAA aaa 10 1
BBB bbb 30 2

~ $ perl -F'\s+' -lane  '@num=qx/cat num/;print "@F[@num]"' colonne.txt
age sexe
10 1
30 2

~ $
0

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