Extraction de colonnes

sky -  
dubcek Messages postés 18627 Date d'inscription   Statut Contributeur Dernière intervention   -
Bonjour,

Dans un fichier j'ai un tableau de 100000 colonnes et 800 lignes. Je voudrai extraire de ce fichier 500 colonnes. Les numéros des colonnes à extraire sont mises dans un autre fichier.
J'ai essayé plusieurs commande avec sed, ou encore awk mais je n'y suis pas arrivée.
Est ce que vous savez s'il est possible de faire cela avec le terminal de linux?

Je vous remercie par avance.

3 réponses

  1. dubcek Messages postés 18627 Date d'inscription   Statut Contributeur Dernière intervention   5 659
     
    hello
    soit le fichier num qui contient les N° de colonnes à afficher, 1 par ligne et le fichier fic qui contient les 100000 colonnes:
    $ awk 'BEGIN{while("cat num"|getline)x[n++]=$1} ; {for(i=0;i<n;i++)printf $x[i] OFS; print ""}' fic > resultat
    0
  2. sky
     
    salut,

    merci beaucoup pour ta réponse. J'ai essayé ton code mais il me dit qu'il y a une erreur avec awk: program limit exceeded : maximum number of field = 32767.

    Je pense que c'est donc les 100000 colonnes qu'il n'apprécie pas...

    est ce qu'il existe une autre méthode??

    Merci encore.
    0
    1. dubcek Messages postés 18627 Date d'inscription   Statut Contributeur Dernière intervention   5 659
       
      effectivement, awk est limité à 32K champs, utilise gawk à la place
      $ seq -s " " 1 200000 > a
      $ gawk -v c=40001 -v c2=100002 -v c3=199998 '{print NF, $c, $c2, $c3}' a
      200000 40001 100002 199998
      $
      0
  3. lami20j Messages postés 21506 Date d'inscription   Statut Modérateur, Contributeur sécurité Dernière intervention   3 571
     
    Salut,

    Essaie comme ça
    ~ $ cat num
    2
    3
    
    ~ $ cat colonne.txt
    nom prenom age sexe
    AAA aaa 10 1
    BBB bbb 30 2
    
    ~ $ perl -F'\s+' -lane  '@num=qx/cat num/;print "@F[@num]"' colonne.txt
    age sexe
    10 1
    30 2
    
    ~ $

    0