Parser un fichier en PERL
Résolu
Bonjour,
J'ai un petit souci pour parser un fichier en PERL.
J'ai un fichier de type GFF et j'aimerais ne conserver que certains élements.
J'ai 3 lignes et je voudrais en conserver que 2 au final; mais cela en prenant une donnée de la ligne 1 en l'intégrant dans la ligne 2.
Voiçi en exemple. (chaque champ sont séparé par des tabulations).
lala parents Dupont;Martin;filiation;honneur
loulou fille Dupont;
toto fils Dupont;
Au final je voudrais cela:(Il s'agit de récupérer Martin et de l'ajouter à la colonne suivante seulement)
loulou fille Dupont;Martin
toto fils Dupont;
Dans un premier temps j'obtiens cela:
Martin
loulou fille Dupont;
toto fils Dupont;
Mais je bloque pour faire passer Martin dans la ligne suivante
open (GFF, "< aaaa.gff") or die("Impossible de lire dans le fichier $!");
my $i=0;
while( my $ligne=<GFF>){
$i++;
//pour récupérer Martin
if($ligne =~ /(^lala)\t(.+)\t(.+);(.+);(.+);(.+)$/){
$ligne=$4;
}
}
close (GFF);
Pourraist-on m'aider merci par avance.
J'ai un petit souci pour parser un fichier en PERL.
J'ai un fichier de type GFF et j'aimerais ne conserver que certains élements.
J'ai 3 lignes et je voudrais en conserver que 2 au final; mais cela en prenant une donnée de la ligne 1 en l'intégrant dans la ligne 2.
Voiçi en exemple. (chaque champ sont séparé par des tabulations).
lala parents Dupont;Martin;filiation;honneur
loulou fille Dupont;
toto fils Dupont;
Au final je voudrais cela:(Il s'agit de récupérer Martin et de l'ajouter à la colonne suivante seulement)
loulou fille Dupont;Martin
toto fils Dupont;
Dans un premier temps j'obtiens cela:
Martin
loulou fille Dupont;
toto fils Dupont;
Mais je bloque pour faire passer Martin dans la ligne suivante
open (GFF, "< aaaa.gff") or die("Impossible de lire dans le fichier $!");
my $i=0;
while( my $ligne=<GFF>){
$i++;
//pour récupérer Martin
if($ligne =~ /(^lala)\t(.+)\t(.+);(.+);(.+);(.+)$/){
$ligne=$4;
}
}
close (GFF);
Pourraist-on m'aider merci par avance.