Erreur critique lors d'un transfert FTP

Bonjour,

Cela fait plusieurs jours que j'essaie en vain de transférer des fichiers sur le serveur de l'académie de strasbourg (je suis responsable du site de l'école de mes enfants) et pas moyen..... Cela fait des années que je fais cela à titre pro et ça marche très bien. Mes sites sont en SPIP et j'utilise Filezilla.. no souci.
Là, le site précédent de l'école était conçu avec ToWeb et je voulais le changer en installant SPIP. Tout le boulot est fait, mais pas moyen de le transférer sur le serveur. Je n'arrive pas à l'installer à la racine. J'arrive pourtant à me connecter (login + mot de passe = ok), je vois les fichiers déjà installés, j'arrive à transférer des fichiers dans des dossiers déjà installés, mais c'est tout. Pas moyen de renommer un dossier ni de "toucher" à la racine du site... J'ai essayé d'autres logiciels FTP et j'obtiens le même résultat.
Je ne sais plus quoi faire ! A l'aide !!!

Merci d'avance !

Configuration: Windows XP
Firefox 3.5.3