[JavaScript] IE 6 n'aime pas un fichier JS

Bonjour à toutes et à tous,

Après de nombreuses recherches je me décide à poster ici.
Je travail sur un site web déjà existant et je viens de le prendre en main. En voulant tester le site j'ai pu me rendre compte d'une incompatibilité avec IE 6. Malheureusement le nombre d'utilisateurs actuel représente une part trop importante pour être négligé.

Le bug se traduit pas des "alertes" bien propres à IE où il m'indique "Object Expected". L'effet est désastreux et empêche la navigation sur le site car celle-ci se fait essentiellement par onglets gérés en JavaScript.
En cherchant une solution j'ai pu me rendre compte qu'il s'agit d'un problème d'inclusion de mon script dans la page html. Celle-ci se fait de la manière suivante :
<script src="./JS/MonScript.js" type="text/javascript"></script>

J'ai d'autre fichier JS qui sont aussi linkés à cette page et ne semblent pas posé de problème. Afin de valider mon hypothèse j'ai tout simplement recopié le code dans le header, ce qui fait disparaitre les bugs.
J'ai par ailleurs vérifié 118 fois le nom du fichier, son emplacement avec des tests tel que le déplacement du script.

Je suis ouvert à toutes propositions constructives. :)