Probleme boot linux et windows

Bonjour,Je vous explique le probleme j'ai vista sur mon disque dure principal et linux sur un autre disque dure externe ..le probleme est que quand je redemarre mon pc et que mon disque externe n'Est pas branché mon windows ne demarre plus car il doit absolument a priory demarrer avec linux au boot pour ensuite choisir windows pour pouvoir y acceder quand il me demande le choix entre linux et vista ...... voila j'Aimerais savoir comment enlever le boot de linux car si je format mon disque dure externe je vais avoir le meme probleme je l'ai deja essayé sauf que la je vais etre bloqué et la seule solution est de formater.. merci de maider:)