Répertoire FTP pour mise en ligne de 2 sites

Bonjour,
J'ai un souci et j'aimerai un p'tit coup de main
Exposition de la situation :
J'ai 2 domaines chez 1 & 1, ils sont actifs
Les 2 sites sont prets
Ils ont été développés sur Pub.
J'ai installé File Zila pour mon transfert FTP
L'hébergeurs a crée un utilisateur principal avec répertoire = /.
Dans FileZila sous le rep. /. j'ai un fichier de log, images..../... vides et crées par l'hébergeur

Quand je transfert le premier site, index+fichier d'images pas de problème, le site est en ligne
Quand je transfert le deuxième site, index+fichier d'images ... ca bloque... il me demande l'autorisation de remplacer les fichiers du premier par le deuxième...

- Si je renomme mes fichiers pour éviter d'avoir 2 fois les mêmes de fichiers, les fichiers renommés ne déclenchent pas l'activation du site-
- j'ai crée des répertoires pour chacun des 2 site, là j'ai une page internet avec l'arborescence de mon serveur
- j'ai donc crée 2 utilisateurs FTP supplémentaires avec FTPnom de domaine+ user et MDP différent du principal utilisateur et j'ai déposé, là aussi j'ai l'arborescence qui apparait sur le NEt quand je tape l'adresse d'un du site ...

Question :
Comment je peux faire pour mes mettre mes 2 sites en lignes ?

merci de m'éclairer de vos lumières, car là ...
c'est la première fois que je fais ce genre de manip, donc, c'est pas très clair pour moi....

@+