Lire des images dicom une à une

Question

Bonjour, 

J'ai un dossier qui contient des images dicom. J'aimerais créer une fonction qui prend en entrée le dossier contenant les images, et qui lit une à une ces images en stockant certaines de leurs données dans une liste. Comment puis je faire svp ?

mamiemando · Answer

Bonjour,

Tu peux itérer sur les fichiers d'un dossier avec la fonction os.walk.

Ensuite, tout dépend du module python que tu utilises pour lire des fichiers dicom. Si tu utilises pydicom, tu peux regarder les exemples fournis dans la documentation.

Dans l'idée ça ressemblerait à quelque chose du genre :

#!/usr/bin/env python3
# -*- coding: utf-8 -*-

import os
from pprint import pprint
from pydicom import dcmread

data = list()
path = "/my/folder/containing/dcm"
for (dirname, _, basenames) in os.walk(path):
    for basename in basenames:
        filename = os.path.join(dirname, basename)
        if not filename.endswith(".dcm"):
            continue
        print(f"Reading {filename}")
        with open(filename, "rb") as infile:
            ds = dcmread(infile)
            data.append(ds)
pprint(data)

Bonne chance

Lire des images dicom une à une

1 réponse

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