Question debutant. Comment modifier l'apparence d'un site web ?

Bonjour,

Je me suis décidé à apprendre le JS.
Il y a une chose que j'aime faire c'est modifier l'apparence des pages web comme wikipédia pour mon plaisir perso.
J'utilisais jusque là STYLUS qui n'autorise que le css.

Mais j'ignore qu'est ce qui pourrait me permettre de pouvoir modifier un site à l'aide de scripts ?
J'ai lu quelque chose comme greasemonkey.
Ensuite. Que faut-il faire d'autres ?
Je ne sais même pas s'il y a une structure a mettre comme pour HTML 5.
Dans mon cas j'aimerais ajouter un script qui permettait de faire une diapo de wallpapers en fondu.

Merci pour votre aide.