Problème pour lire mon fichier ligne par ligne : boucle infinie

Bonjour,
J'ai un problème assez urgent. Je veux lire mon fichier ligne par ligne pour appliquer à chaque ligne des fonctions. Mais quand je le lis, il ne lit uniquament la première ligne du fichier en boucle. Je me retrouve donc dans une boucle infinie. Comme lire la totalité de mon fichier ligne par ligne et non seulement la première ligne ?

Merci

Code :

        def creation_dico(dic_localisation_atlas,name_file,exome_colonne,cohorte_name,dico_transm_ensembl):
         
            dico_DTM={}
            f_in=open(name_file,"r")
         
            dico_file={}
         
            path="vcf_output/"+cohorte_name
         
            if os.path.isdir(path)==False:
                os.mkdir(path,0o755)
         
            for k in exome_colonne:
         
                dico_file[k]=open(path+"/"+k+".txt","w")
                dico_file[k].write("##CHROMOSOME\tN_SNP\tN_gene\t\tInfo\tSNP_Donneur\tSNP_Receveur\n")
         
            colonne7=[]
            colonne7bis=[]
            colonne7ter=[]  
         
            liste_SNP=[]
            variantsYN=[]
         
            chro=1
            indel=0
         
            buf_score={}
            bufs=0
            rf=f_in.readline
            read=rf()
            a=0
         
         
            while read:
         
         
                row=read.split("\t")
                print row
         
         
                if row[0][0]!="#":
         
                    if chro!=row[0]:
                        chro=row[0]
                        print("chromosome",chro)
         
                    liste_SNP.append(row[1])
         
                 variantsYN.append(row[7])
         
                 liste_g=liste_genes(variantsYN)
         
                 liste_transcrit=f_liste_transcrit(variantsYN)
         
                        if len(variantsYN)>0:
                            for k in exome_colonne:
              Variants_communs=comptage_SNP(row[exome_colonne[k][1]],row[exome_colonne[k][0]],row[1],k,variantsYN,dico_DTM,dic_localisation_atlas,liste_g,dico_transm_ensembl,liste_transcrit)
         
            f_in.close()
         
            print("Paire de patient, score global,score transmembrannaire protein atlas, score secretion, score transmembrannaire Ensembl")
         
            for keys in exome_colonne:
                print(keys,exome_colonne[keys][2],exome_colonne[keys][3],exome_colonne[keys][4],exome_colonne[keys][5])  
         
            for k in exome_colonne:
                dico_file[k].close() 
         
         
         
        if os.path.exists("vcf_output")==False:
            os.mkdir("vcf_output")
         
         
        Paris_Cohorte={}
        Paris_Cohorte["1"]=[31,11,0,0,0,0]
        Paris_Cohorte["2"]=[41,13,0,0,0,0]
        Paris_Cohorte["3"]=[40,33,0,0,0,0]
         
         
        parser = argparse.ArgumentParser()
         
        choice = parser.add_argument_group('Choix cohorte')
        choice.add_argument('-c','-cohorte',type=str,choices=["vcf"],required=True)
         
        args = parser.parse_args()
         
        path_in="localisation_simplified.csv"
         
        dic_localisation_atlas=open_localisation(path_in)
         
        membrannaire="transmembranaire/"
         
         
        dico_transm_ensembl=file_ensembl(membrannaire)
         
         
        if args.c :
         
            if args.c=="vcf" :
         
                creation_dico(dic_localisation_atlas,"vcf.vcf",Paris_Cohorte,"Paris",dico_transm_ensembl)

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exemple de fichier :

##fileformat=VCFv4.3
##FILTER=<ID=PASS,Description=All filters passed>
#CHROM  POS ID  REF ALT QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  ...
1   783071  rs142849724 C   T   .   PASS    ENSG00000228794;ENST00000624927|ENST00000623808|ENST00000445118|ENST00000448975|ENST00000610067|ENST00000608189|ENST00000609139|ENST00000449005|ENST00000416570|ENST00000623070|ENST00000609009|ENST00000622921 GT  C;  C;  T;|C;   C;  T;|C;   C;  C;  C;  C;  C;|T;   C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;  C;|T;   C;  C;  C;  C;|T;   C;  C;  C;

sortie du terminal :

['##fileformat=VCFv4.3\n']
['##fileformat=VCFv4.3\n']
['##fileformat=VCFv4.3\n']

Merci