Extraire chaine de caractère

Bonjour
Alors voilà j'ai un petit problème : Voici mon code ci dessous :
code :

import java.util.Collection;
import java.util.LinkedHashSet;
 
public class Extract {
 
 public static void main(String[] args) {
 
   String zoneB = "#>";
   String zoneE = "#<";
   String valueB = "{";
   String valueE = "}";
  
 
  
  Collection<String> mots = new LinkedHashSet<>(); // si on voulait avoir tous les mots : Collection<String> mots =  new ArrayList<>();  
 
 
  String string = "#----------------------------------------------------------------------\n" +
            "#{toto}"+
      "# Variables\n" +
      "#----------------------------------------------------------------------\n" +
      "#> should be formatted by calmod_python\n" +
      "set conf_etudie = \"{etude}_{SIT}_sylda_{h_sylda}\"\n" +
      "set dir_listing  = \"{userPath}/{etude}/script/{etude}_{SIT}_sylda_{h_sylda}/{conf_cu}/{logName}/{horodate}/listing\"\n" +
      "set dir_tem = \"{userPath}/{etude}/script/{etude}_{SIT}_sylda_{h_sylda}/{conf_cu}/{logName}/{horodate}/temoin\"\n" +
      "set dir_res = \"{userPath}/{etude}/script/{etude}_{SIT}_sylda_{h_sylda}/{conf_cu}/{logName}/{horodate}/results\"\n" +
      "set dir_UCI_cree = \"{userPath}/{etude}/script/{etude}_{SIT}_sylda_{h_sylda}/{conf_cu}/{logName}/{horodate}/UCI_cree\"\n" +
      "#< end the formatted line\n" +
      "set fic_tem =  calmod.tem\n" +
      "#----------------------------------------------------------------------\n";
 
  String[] tab = string.split("\n").clone();
 
   for ( int i = 0; i < tab.length; i++ ) { // on pourrait faire comme ça aussi : for(String line : tab ) { 
 
       System.out.println(i + " : " + tab[i]);
 
       int index1 = tab[i].indexOf("{"); // nous donne l'emplacement du premier "{"
       while( index1>=0 ) { // tant qu'on trouve une {
 
 
           int index2 = tab[i].indexOf("}", index1); // on cherche le } qui suit
           if ( index2>= 0 ) { // si on trouve un }
 
                  // on pourrait tester ici un cas d'erreur si on a 2 { qui se suivent sans } entre :
                   int index3 = tab[i].lastIndexOf("{", index2); // on cherche le { qui précède le }
                   if ( index3!=index1 ) { // si ce n'est pas le même que index1, on a forcément { ... { ... }
                        System.err.println("Problème dans le fichier : { non fermée en " + index1 );
                   }
 
                   String x = tab[i].substring(index1+1, index2); // on extrait le mot trouvé entre { et } // ICI CORRECTION tab[i] à la place de yes et le +1 que j'ai oublié
                   // System.out.println("x = " + x);  // et on l'affiche (ou on le stocke dans une ArrayList pour l'utiliser ailleurs...)
 
                        mots.add( x ); // on stocke le mot    
 
 
           }
           else {
 
               // on a trouvé un { mais pas de } après : c'est probablement une erreur
               System.err.println("Problème dans le fichier : { non fermée en " + index1);
               break; // on sort de la boucle, parce que ce n'est pas la peine de continuer de chercher
 
           }
 
           index1 = tab[i].indexOf("{", index2 ); // on cherche le mot suivant dans la ligne
 
    } // fin de la boucle while
 
   } // fin de la boucle for
 
   for(String current : mots) // pour chaque String current dans mots
  {
     System.out.println(current); // on affiche current
  }
   
   
    // pour trouver les positions #> et #<
   System.out.print("Found Index :" );
     System.out.println(string.indexOf( "#>" ));  
     System.out.print("Found Index :" );
     System.out.println(string.indexOf( "#<" ));
        
     // pour extraire la chaîne entre la position premier incluse et la position dernier exclue.   
        int a = string.indexOf("#>");
        int b = string.indexOf("#<");
 } 
 
}

en sortie j'ai :
0 : #----------------------------------------------------------------------
1 : #{toto}# Variables
2 : #----------------------------------------------------------------------
3 : #> should be formatted by calmod_python
4 : set conf_etudie = "{etude}_{SIT}_sylda_{h_sylda}"
5 : set dir_listing = "{userPath}/{etude}/script/{etude}_{SIT}_sylda_{h_sylda}/{conf_cu}/{logName}/{horodate}/listing"
6 : set dir_tem = "{userPath}/{etude}/script/{etude}_{SIT}_sylda_{h_sylda}/{conf_cu}/{logName}/{horodate}/temoin"
7 : set dir_res = "{userPath}/{etude}/script/{etude}_{SIT}_sylda_{h_sylda}/{conf_cu}/{logName}/{horodate}/results"
8 : set dir_UCI_cree = "{userPath}/{etude}/script/{etude}_{SIT}_sylda_{h_sylda}/{conf_cu}/{logName}/{horodate}/UCI_cree"
9 : #< end the formatted line
10 : set fic_tem = calmod.tem
11 : #----------------------------------------------------------------------
toto
etude
SIT
h_sylda
userPath
conf_cu
logName
horodate
Found Index :163
Found Index :707

Mon but c'est de ne plus avoir toto en sortie car il ny a pas pas le #> devant lui.
Que me conseillez vous ?

EDIT: Précision du langage dans la coloration syntaxique.