Execution script R avec PHP

Fermé
charneas Messages postés 20 Date d'inscription dimanche 12 août 2012 Statut Membre Dernière intervention 20 février 2014 - Modifié par charneas le 20/02/2014 à 15:33
charneas Messages postés 20 Date d'inscription dimanche 12 août 2012 Statut Membre Dernière intervention 20 février 2014 - 20 févr. 2014 à 20:34
Bonjour,

J'ai un soucis, en effet j'ai une page php et à partir de cette page je veux lancer un script R, hors lorsque je lance la page il ne fait rien du tout.

Voici le script php :




<html>

<head>Calcul de corrélation</head>

<body>

<?php

exec('Rscript corr.R');

?>

</body>

</html>

Voici le code en R qui marche parfaitement quand je le lance à part :


#!/usr/bin/Rscript

#script R
setwd("C:\\Program Files (x86)\\EasyPHP-DevServer-14.1VC9\\data\\localweb\\projects")
data<-read.csv("temp.csv", header=FALSE, sep=";", dec=",", row.names=1)
data2<-t(data)
#bact<-data.frame(bact1=c(5,5,3,12),bact2=c(8,6,7,11),bact3=c(9,3,11,2))
dim(data2)
coef<-cor(data2, method="spearman")
coef
write.csv2(coef,file='coef.csv')

Est-ce que quelqu'un pourrait m'aider s'il vous plait?

Cordialement

charneas

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3 réponses

charneas Messages postés 20 Date d'inscription dimanche 12 août 2012 Statut Membre Dernière intervention 20 février 2014
20 févr. 2014 à 19:08
Bon du coup je vais lancer une commande en batch qui va exécuter ma ligne de commande mais le soucis c'est qu'il va ouvrir Rstudio et ne va pas lancer le programme alors que je fais ça pour l'automatiser...

Si quelqu'un a une idée...
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Pitet Messages postés 2826 Date d'inscription lundi 11 février 2013 Statut Membre Dernière intervention 21 juillet 2022 525
20 févr. 2014 à 20:16
Salut,

Peut-être un problème de droits ?

Tu peux afficher le résultat de la commande exécutée avec exec() en utilisant les paramètres $output et $return_val :
exec('Rscript corr.R', $output, $return_val);
var_dump($output);
var_dump($return_val);


Mais pourquoi utiliser un script php pour automatiser un autre script, puisqu'il faudra ensuite automatiser ce script php ? Tu pourrais utiliser une tache cron pour directement automatiser l'appel à ton script R ?

Bonne journée
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charneas Messages postés 20 Date d'inscription dimanche 12 août 2012 Statut Membre Dernière intervention 20 février 2014
20 févr. 2014 à 20:34
Salut,

J'ai fait comme ça car mon sujet d'examen m'imposait d'utiliser php, mais j'ai résolu mon soucis et du coup cela fonctionne bien maintenant grâce à cette page où la personne donne les 2 étapes : https://r.789695.n4.nabble.com/Automating-R-script-with-Windows-7-td4446693.html


Merci d'avoir essayé de m'aider ;)
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