Virus sur disque dur externe

Salut.
J'ai un ordinateur qui a souvent des problèmes avec des virus, notamment des Trojan et comme je stocke régulièrement mes données sur un disque dur externe, je voudrais connaitre les risques des virus sur ce dd (risque de contagion d'autres ordinateurs...). De plus, si vous pouviez m'indiquer comment faire pour éviter que des virus se retrouvent sur d'autres ordinateurs après connection avec le dd, ou comment s'en protéger, ce serait sympa.
J'ai un ordi portable depuis quelques jours et j'ai peur que des fichiers contenus sur mon dd externe ne soient infectés et n'infectent ce nouvel ordi.
Merci !