Problème code php

Salut à tous
Debutant en php, je dois faire un petit programme pour récupérer des chaines de caractère dans un fichier texte
en décalent à chaque fois de 1. les chaines ainsi récupérées sont placés dans un tableau.

<?
$fp=fopen("../sequence.fasta","r");
$b #longueur de la chaine

for($a=0,$a=file($fp),$a++){
$tab=array(subst($fp,$a,$b))


Je dois aussi eliminer les ligne qui commence par le caractère '>'
foreach($lignes as $ligne) {
if(strpos($ligne,'>')=== true){
"\n"}
else{ echo "$ligne"};
}
}
?>
Voilà le code ne fonctionne évidement pas. Si quelqun peut m'aider
Merci d'avance