Debutant cherche script en perl

Fermé
Balidemonas167 - 12 avril 2009 à 06:47
lami20j Messages postés 21331 Date d'inscription jeudi 4 novembre 2004 Statut Modérateur, Contributeur sécurité Dernière intervention 30 octobre 2019 - 12 avril 2009 à 10:30
Bonjour,

Je suis biologiste, et debutant en perl. Je recherche un peu d'aide. J'ai un fichier .txt organise ainsi:

>numero de sequence, site de prelevement
sequence ADN

et ceci 15000 fois.

par exemple
>JGST343553676, DT454
AATCGGGCTACCTATA

Je cherche a extraire de ce fichier uniquement les sequences (et leur numero) correspondant au site de prelement identifie DT456 (le fichier est dans le desordre, un meme site peu revenir plusieurs fois).

Je cherche ensuite un deuxieme script qui me permettrait de remettre de l'ordre dans ce fichier, et donc de trier les sequences en fonction de leur numero de prelevement.

Merci d'avance de votre aide !
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1 réponse

lami20j Messages postés 21331 Date d'inscription jeudi 4 novembre 2004 Statut Modérateur, Contributeur sécurité Dernière intervention 30 octobre 2019 3 569
12 avril 2009 à 10:30
Salut,

Et avec les doublons tu veux faire quoi?

Tu peux mettre ton fichier sur cjoint.com?
Tu pourras aussi donner un exemple concret de ce que tu veux obtenir.
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