Format vidéo préféré de Final Cut Express

Bonjour,
Je souhaite monter des clips à partir de vidéos trouvées sur internet pour mon plaisir personnel. Je compte utiliser Final Cut Express (sauf si quelqu'un a une meilleure idée). Vu que les vidéos que je récupère sont de tous les formats possibles, dont certains non-reconnus par FCE, je me suis dit qu'il serait préférable de tout unifier en un seul format via un convertisseur genre ffmpeg. Quel est alors le meilleur format à choisir pour faire ça? Est-il possible de le faire en série? (beaucoup de vidéos d'un coup)
Merci beaucoup