Homogénéiser un fichier csv

Résolu
zigroful Messages postés 20 Statut Membre -  
dubcek Messages postés 18627 Date d'inscription   Statut Contributeur Dernière intervention   -

Bonjour à tous,

je cherche depuis quelques jours une solution avec sed, awk ou bash à ce problème:

Je dispose d'un fichier csv de 5 champs et 300 enregistrements. Le séparateur des champs est un point-virgule.

Les champs ne sont pas tous remplis et là ou l'enregistrement est incomplet, les séparateurs ne figurent plus.

Exemple: voici en exemple

ET1;ET2;ET3;ET4;ET5
a1;a2;a3
b1
c1;c2;
d1;d2;d3;d4;

Je voudrait transformer ce tableau en :

ET1;ET2;ET3;ET4;ET5
a1;a2;a3;;
b1;;;;
c1;c2;;;
d1;d2;d3;d4;

... c'est-à-dire rétablir le nombre d'enregistrements par ligne (5 ici), en rajoutant autant de séparateurs (et de champs vides) qu'il faut.

Je ne trouve pas le moyen de répéter de manière paramétrée un caractère (ici ;) en fin de ligne de manière à reconstituer un enregistrement ayant le même nombre de champs que la ligne d'entête.

Quelqu'un aurait-il une idée sur la manière de s'y prendre en n'utilisant que awk, sed ou bash ?

5 réponses

  1. dubcek Messages postés 18627 Date d'inscription   Statut Contributeur Dernière intervention   5 660
     

    hello

    $ awk 'BEGIN {FS=OFS=";"} {NF=5; print $0}' fichier
    ET1;ET2;ET3;ET4;ET5
    a1;a2;a3;;
    b1;;;;
    c1;c2;;;
    d1;d2;d3;d4;
    
    2
    1. mamiemando Messages postés 33228 Date d'inscription   Statut Modérateur Dernière intervention   7 944
       

      Élégant, j'aime :-)

      0
    2. zigroful Messages postés 20 Statut Membre
       

      J’ai essayé cette méthode en redirigeant la sortie sur le fichier d’entree, mais ça donne comme résultat un fichier vide. En revanche quand la sortie est standard, tout va bien ! Je ne comprends pas pourquoi ça donne un fichier vide quand on redirige la sortie sur le fichier d’entree. 

      0
      1. dubcek Messages postés 18627 Date d'inscription   Statut Contributeur Dernière intervention   5 660 > zigroful Messages postés 20 Statut Membre
         

        le fichier de sortie doit être différend du fichier d'entrée

        0
      2. dubcek Messages postés 18627 Date d'inscription   Statut Contributeur Dernière intervention   5 660 > dubcek Messages postés 18627 Date d'inscription   Statut Contributeur Dernière intervention  
         

        pour  modifier le fichier original (comme sed -i)

        awk -i inplace 'BEGIN {FS=OFS=";"} {NF=5; print $0}' fichier
        

        il faut gawk 4.1.0

        chez moi awk==gawk

        0
  2. jee pee Messages postés 31889 Date d'inscription   Statut Modérateur Dernière intervention   9 982
     

    Bonjour,

    Une méthode plus simple en utilisant Excel, ouvrir le CSV et le réenregistrer en un nouveau CSV, Excel devrait en faire un fichier cohérent.


    0
  3. mamiemando Messages postés 33228 Date d'inscription   Statut Modérateur Dernière intervention   7 944
     

    Bonjour,

    Préliminaires

    Il faudrait préciser deux trois aspects, notamment

    • Entrée : d'où sont lues les données d'entrées
      • Soit depuis un fichier donné, dont le nom est passé en paramètre
      • Soit depuis l'entrée standard
    • Sortie : où sont écrites les données corrigées
      • Dans le fichier d'entrée (modification en place, comme avec sed)
      • Dans un autre fichier
        • Soit dans un fichier donné, dont le nom est passé en paramètre
        • Soit vers la sortie standard
    • Je te recommande plutôt de lire sur l'entrée standard et d'écrire sur la sortie standard et de faire les éventuelles redirections avec les opérateurs < et > au moment d'appeler ton script.

    Concernant le traitement lui-même, je suppose qu'on détermine le nombre de champs attendu à l'aide de la première ligne (et part du principe que les lignes suivantes en contienne au plus ce nombre).

    En shell pur

    Principe: on utilise cette syntaxe pour compter le nombre de ";". Ensuite il suffit à l'aide d'une boucle for d'écrire autant que fois que nécessaire les ";" manquants (tu peux utiliser seq) et on n'oublie pas de passer à la ligne (avec echo).

    mon_script.sh :

    #!/bin/bash
    
    while read -r line; do
        echo -ne "$line"
        res="${line//[^;]}"
        n="${#res}"
        if [ -z "$expected" ];
        then
            expected="$n"
        fi
        if (( $n < $expected ));
        then
            for i in $(seq 1 $((expected - n)))
            do
                echo -ne ";"
            done
        fi
        echo ""
    done

    Ce programme s'utilise comme suit :

    chmod a+x mon_script.sh
    ./mon_script.sh < data_in.txt > data_out.csv

    En awk

    Tu peux écrire un programme "plus naturel" qui pour chaque ligne compte le nombre de ";", puis écrit le nombre de ";" manquants. La syntaxe de awk étant proche de celle du C (en plus simple), il n'y a pas de grosse difficulté. Si tu pars sur awk, pas besoin d'autre chose (ni grep, ni sed, ni awk).

    toto.awk

    #!/usr/bin/awk -f
    
    BEGIN {
        expected = -1;
    }
    
    {
        n = 0;
        for (i = 0; i < length($0); i++) {
            c = substr($0, i, 1);
            if (c == ";") {
                n++;
            }
        }
        if (expected < 0) {
            expected = n;
        }
        extra = "";
        for (i = 0; i < expected - n; i++) {
            extra = extra ";";
        }
        printf "%s%s\n", $0, extra
    }

    Utilisation :

    chmod a+x toto.awk
    ./toto.awk < data_in.txt > data_out.csv

    Bonne chance

    0
  4. zigroful Messages postés 20 Statut Membre
     

    MILLE MERCI Dubcek !

    0
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  6. zigroful Messages postés 20 Statut Membre
     

    Bonjour Dubceck

    J’ai essayé cette méthode en redirigeant la sortie sur le fichier d’entree, mais ça donne comme résultat un fichier vide. En revanche quand la sortie est standard, tout va bien ! Je ne comprends pas pourquoi ça donne un fichier vide quand on redirige la sortie sur le fichier d’entree. 

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