Homogénéiser un fichier csv
Résoludubcek Messages postés 18789 Date d'inscription Statut Contributeur Dernière intervention -
Bonjour à tous,
je cherche depuis quelques jours une solution avec sed, awk ou bash à ce problème:
Je dispose d'un fichier csv de 5 champs et 300 enregistrements. Le séparateur des champs est un point-virgule.
Les champs ne sont pas tous remplis et là ou l'enregistrement est incomplet, les séparateurs ne figurent plus.
Exemple: voici en exemple
ET1;ET2;ET3;ET4;ET5
a1;a2;a3
b1
c1;c2;
d1;d2;d3;d4;
Je voudrait transformer ce tableau en :
ET1;ET2;ET3;ET4;ET5
a1;a2;a3;;
b1;;;;
c1;c2;;;
d1;d2;d3;d4;
... c'est-à-dire rétablir le nombre d'enregistrements par ligne (5 ici), en rajoutant autant de séparateurs (et de champs vides) qu'il faut.
Je ne trouve pas le moyen de répéter de manière paramétrée un caractère (ici ;) en fin de ligne de manière à reconstituer un enregistrement ayant le même nombre de champs que la ligne d'entête.
Quelqu'un aurait-il une idée sur la manière de s'y prendre en n'utilisant que awk, sed ou bash ?
- Homogénéiser un fichier csv
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5 réponses
hello
$ awk 'BEGIN {FS=OFS=";"} {NF=5; print $0}' fichier ET1;ET2;ET3;ET4;ET5 a1;a2;a3;; b1;;;; c1;c2;;; d1;d2;d3;d4;
Bonjour,
Une méthode plus simple en utilisant Excel, ouvrir le CSV et le réenregistrer en un nouveau CSV, Excel devrait en faire un fichier cohérent.
Bonjour,
Préliminaires
Il faudrait préciser deux trois aspects, notamment
- Entrée : d'où sont lues les données d'entrées
- Soit depuis un fichier donné, dont le nom est passé en paramètre
- Soit depuis l'entrée standard
- Sortie : où sont écrites les données corrigées
- Dans le fichier d'entrée (modification en place, comme avec sed)
- Dans un autre fichier
- Soit dans un fichier donné, dont le nom est passé en paramètre
- Soit vers la sortie standard
- Je te recommande plutôt de lire sur l'entrée standard et d'écrire sur la sortie standard et de faire les éventuelles redirections avec les opérateurs < et > au moment d'appeler ton script.
Concernant le traitement lui-même, je suppose qu'on détermine le nombre de champs attendu à l'aide de la première ligne (et part du principe que les lignes suivantes en contienne au plus ce nombre).
En shell pur
Principe: on utilise cette syntaxe pour compter le nombre de ";". Ensuite il suffit à l'aide d'une boucle for d'écrire autant que fois que nécessaire les ";" manquants (tu peux utiliser seq) et on n'oublie pas de passer à la ligne (avec echo).
mon_script.sh :
#!/bin/bash while read -r line; do echo -ne "$line" res="${line//[^;]}" n="${#res}" if [ -z "$expected" ]; then expected="$n" fi if (( $n < $expected )); then for i in $(seq 1 $((expected - n))) do echo -ne ";" done fi echo "" done
Ce programme s'utilise comme suit :
chmod a+x mon_script.sh ./mon_script.sh < data_in.txt > data_out.csv
En awk
Tu peux écrire un programme "plus naturel" qui pour chaque ligne compte le nombre de ";", puis écrit le nombre de ";" manquants. La syntaxe de awk étant proche de celle du C (en plus simple), il n'y a pas de grosse difficulté. Si tu pars sur awk, pas besoin d'autre chose (ni grep, ni sed, ni awk).
toto.awk
#!/usr/bin/awk -f BEGIN { expected = -1; } { n = 0; for (i = 0; i < length($0); i++) { c = substr($0, i, 1); if (c == ";") { n++; } } if (expected < 0) { expected = n; } extra = ""; for (i = 0; i < expected - n; i++) { extra = extra ";"; } printf "%s%s\n", $0, extra }
Utilisation :
chmod a+x toto.awk ./toto.awk < data_in.txt > data_out.csv
Bonne chance
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Posez votre questionBonjour Dubceck
J’ai essayé cette méthode en redirigeant la sortie sur le fichier d’entree, mais ça donne comme résultat un fichier vide. En revanche quand la sortie est standard, tout va bien ! Je ne comprends pas pourquoi ça donne un fichier vide quand on redirige la sortie sur le fichier d’entree.
Élégant, j'aime :-)
J’ai essayé cette méthode en redirigeant la sortie sur le fichier d’entree, mais ça donne comme résultat un fichier vide. En revanche quand la sortie est standard, tout va bien ! Je ne comprends pas pourquoi ça donne un fichier vide quand on redirige la sortie sur le fichier d’entree.
le fichier de sortie doit être différend du fichier d'entrée
pour modifier le fichier original (comme sed -i)
il faut gawk 4.1.0
chez moi awk==gawk