Convert image en ADN

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Soma1316 Messages postés 17 Date d'inscription vendredi 3 mars 2023 Statut Membre Dernière intervention 25 mai 2023 - 6 mars 2023 à 17:31
brucine Messages postés 14461 Date d'inscription lundi 22 février 2021 Statut Membre Dernière intervention 5 mai 2024 - 6 mars 2023 à 20:03

Bonjour,

Comment convertir une image en sequence d'ADN en python?

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1 réponse

Ça prend un aveugle ou un idiot pour poser la question, et je ne suis pas idiot ...
Qu'est-ce qu'il y a sur ton image? Ça te prendrait peut-être un logiciel de type OCR.

OCR = Optical Character Recognition.

J'ai trouvé ceci mais je ne l'ai pas testé: tesseract

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mariam-j Messages postés 1058 Date d'inscription mercredi 9 mars 2022 Statut Membre Dernière intervention 5 mai 2024
Modifié le 6 mars 2023 à 18:30

Bonjour,
En ajoutant un paramètre au: "RGB"
ça peut devenir possible.
RGBx-->ACGT

Sinon, y a du décalage à prévoir

A part ça, il reste un problème: ACGT ce sont des "unicités", RGB, ce sont des valeurs.

Bref, c'est pas gagné...

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brucine Messages postés 14461 Date d'inscription lundi 22 février 2021 Statut Membre Dernière intervention 5 mai 2024 1 848 > mariam-j Messages postés 1058 Date d'inscription mercredi 9 mars 2022 Statut Membre Dernière intervention 5 mai 2024
6 mars 2023 à 20:03

Non,

Si on parle d'images numériques (et pas par exemple de "clichés" de substances par électrophorèse), il existe plusieurs techniques , la plus "simple" étant le transcodage: chacun des nucléotides se voit attribuer une valeur binaire, par exemple A=00, C=01, G=10, T=11.

Pour revenir à nos moutons, on trouve assez facilement l'exercice résolu sur Internet (et qui reste pour l'instant assez théorique, les possibilités extraordinaires de stockage de fichiers dans l'ADN synthétique restant limitées par le "coût du nucléotide", dont il faut plusieurs milliers par image.)

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