Problème avec le démarrage windows

Bonjour,

J'ai acheter un nouveau pc dont les composants :
-Intel Core i5-4690K (3.5 GHz)
-ASRock B85-PRO4
-LEPA MaxGold GM500, 500W
-DDR3 G.Skill Ripjaws X, 2 x 4 Go, 1600 MHz, CAS 9
-Sapphire Radeon R9 280X Vapor-X Tri-X With Boost, 3 Go
-Seagate Barracuda, 2 To
-Fractal Design Core 3300
-SSD Crucial M550, 256 Go, SATA III

Ajouter à cela mon ancien Disque dur de 500 Go qui n'a pas été formater je tiens à le préciser, donc le problème que j'ai actuellement réside dans le fait que lorsque je démarre le pc avec le SDD seul windows ce lance convenablement mais lorsque je branche un des 2 autre HDD ou les 2 en même temps, Windows ne se lance pas et j'arrive sur le menu de réparation du système de démarrage Windows, et ce en boucle même si à la fin du message je reçois un message disant que la réparation à été un succès ou inversement que le système n'a pu réparer le système de démarrage.