problème dans lib*.so Fermé

Question

Bonjour, Je m'excuse si ma question vous dérange. Je travaille sur un code développer en c++ qui bien marché sur mac os. Ce code va permettre de crée des librairies *.so à partir des *.cc et *.h j'ai utilisé pour cela comme flags : CXXFLAGS = -g -O2 -fPIC -Wall -ldl -D_GNU_SOURCE ,CXX := g++ et $(CXX)-shared -o $(LIBNAME) $(CLIBLIB) $(OUT_OBJS) Cette étape s'est bien passée j'ai obtenu les *.so comme suit : morad@linux-nzlc:~/Musique/workdir> ls library/tklibs/lib/ libAnalyticalJacobians.so libDetGeometry.so libGeomPropagators.so libPatternTestTools.so libSmearingClusterizers.so libTkLayout.so libBaseMagneticField.so libDetLayout.so libKalmanUpdators.so libPatternTools.so libStatUtilities.so libTkNavigation.so libBasicDet.so libDetUtilities.so libMaterialEffects.so libPropagators.so libSurfaceGeometry.so libTrackFitters.so libBasicStripDet.so libDetVolumeGeometry.so libNumericalJacobians.so libRKPropagators.so libTkCommonDet.so libTrajectoryParametrization.so libCommonStripDet.so libGenUtil.so libPatternPrimitives.so libSiPixelDet.so libTkFastSimHit.so libUI.so morad@linux-nzlc:~/Musique/workdir> ./libScript.py ensuite la deuxième étape je voudrais crée l'exécutable pour cela j'ai spécifié les -I,-L et -l dans le makefile et j'ai utilisé les flags suivants : CXX = g++ et $(CXX) -O2 -g -fopenmp $(CILIBLAY) $(OUT_OBJS) $(OBJDIR)/$(MAIN_PROG).o -o $(MAIN_PROG).exe Mais avec ça après l'exécution j'obtiens une erreur : morad@linux-nzlc:~/Musique/workdir/layout/analyze> make mainP=runAnalyze Makefile:85: /home/morad/Musique/workdir/layout/build/analyze/myAnalyze.d: Aucun fichier ou dossier de ce type g++ -MM -I/cern/CLHEP/2.0.4.5/include/ -I/home/morad/Musique/workdir/layout -I/home/morad/Musique/workdir/library/tklibs -I/cern/ROOT/source/root/include -I/usr/include/freetype2/freetype/ -I/usr/include/freetype2 -I/cern/Minuit2/5.28.00/include -I/usr/include/libxml2 -I/usr/include/libxml++-2.6 -I/usr/lib/libxml++-2.6/include/ -I/usr/include/glibmm-2.4/ -I/usr/lib/glibmm-2.4/include/ -I/usr/include/sigc++-2.0/ -I/usr/lib/sigc++-2.0/include/ -I/usr/include/glib-2.0/ -I/usr/lib/glib-2.0/include/ -I/cern/gettext/0.18.2/include/ myAnalyze.cc > /home/morad/Musique/workdir/layout/build/analyze/myAnalyze.d.$$; \ sed 's,$myAnalyze$\.o[ :]*,\1.o /home/morad/Musique/workdir/layout/build/analyze/myAnalyze.d : ,g' < /home/morad/Musique/workdir/layout/build/analyze/myAnalyze.d.$$ > /home/morad/Musique/workdir/layout/build/analyze/myAnalyze.d; \ rm -f /home/morad/Musique/workdir/layout/build/analyze/myAnalyze.d.$$ g++ -c -I/cern/CLHEP/2.0.4.5/include/ -I/home/morad/Musique/workdir/layout -I/home/morad/Musique/workdir/library/tklibs -I/cern/ROOT/source/root/include -I/usr/include/freetype2/freetype/ -I/usr/include/freetype2 -I/cern/Minuit2/5.28.00/include -I/usr/include/libxml2 -I/usr/include/libxml++-2.6 -I/usr/lib/libxml++-2.6/include/ -I/usr/include/glibmm-2.4/ -I/usr/lib/glibmm-2.4/include/ -I/usr/include/sigc++-2.0/ -I/usr/lib/sigc++-2.0/include/ -I/usr/include/glib-2.0/ -I/usr/lib/glib-2.0/include/ -I/cern/gettext/0.18.2/include/ myAnalyze.cc -o /home/morad/Musique/workdir/layout/build/analyze/myAnalyze.o g++ -c -I/cern/CLHEP/2.0.4.5/include/ -I/home/morad/Musique/workdir/layout -I/home/morad/Musique/workdir/library/tklibs -I/cern/ROOT/source/root/include -I/usr/include/freetype2/freetype/ -I/usr/include/freetype2 -I/cern/Minuit2/5.28.00/include -I/usr/include/libxml2 -I/usr/include/libxml++-2.6 -I/usr/lib/libxml++-2.6/include/ -I/usr/include/glibmm-2.4/ -I/usr/lib/glibmm-2.4/include/ -I/usr/include/sigc++-2.0/ -I/usr/lib/sigc++-2.0/include/ -I/usr/include/glib-2.0/ -I/usr/lib/glib-2.0/include/ -I/cern/gettext/0.18.2/include/ runAnalyze.cxx -o /home/morad/Musique/workdir/layout/build/analyze/runAnalyze.o g++ -O2 -g -fopenmp -L/home/morad/Musique/workdir/library/tklibs/lib -L/home/morad/Musique/workdir/layout/lib -lxmlgeom -ltrack -lcross -lMaterialEffects -lPropagators -ltracking -lgeom -lStatUtilities -lAnalyticalJacobians -ltkhist -lxmltkgeom -lutils -lopt -ldraw -lanalyze -L/usr/lib -lGeomPropagators -lPatternPrimitives -lSurfaceGeometry -lBaseMagneticField -lUI -lGenUtil -lSiPixelDet -lSmearingClusterizers -lBasicDet -lTrackFitters -lTkFastSimHit -lCommonStripDet -lDetLayout -lTkLayout -lDetGeometry -lKalmanUpdators -lTkCommonDet -lPatternTools -lTrajectoryParametrization -lBasicStripDet -lDetUtilities -lDetVolumeGeometry -lPatternTestTools -lRKPropagators -lTkNavigation -lNumericalJacobians -lxml++-2.6 -lxml2 -lglibmm-2.4 -lgobject-2.0 -lsigc-2.0 -lglib-2.0 -L/cern/ROOT/source/root/lib -L/cern/Minuit2/5.28.00/lib -lCore -lCint -lRIO -lNet -lHist -lGraf -lGraf3d -lGpad -lTree -lRint -lPostscript -lMatrix -lPhysics -lMathCore -lThread -lfreetype -lz /usr/lib/libbz2.so.1.0.6 -lpthread -lm -ldl -lMinuit2 -L/cern/CLHEP/2.0.4.5/lib/ -lCLHEP-2.0.4.5 /usr/lib/libstdc++.so.6 /home/morad/Musique/workdir/layout/build/analyze/myAnalyze.o /home/morad/Musique/workdir/layout/build/analyze/runAnalyze.o -o runAnalyze.exe /home/morad/Musique/workdir/library/tklibs/lib/libSmearingClusterizers.so: undefined reference to 'TrivialROUSetter::set(Module)' /home/morad/Musique/workdir/library/tklibs/lib/libTkLayout.so: undefined reference to 'FixTIDTopology::recreateTopologies()' /home/morad/Musique/workdir/library/tklibs/lib/libSmearingClusterizers.so: undefined reference to 'TkDetTypeName::shortName(DetType const&)' /home/morad/Musique/workdir/library/tklibs/lib/libTkLayout.so: undefined reference to 'DetUnitGluer::glue(__gnu_cxx::__normal_iterator > >, __gnu_cxx::__normal_iterator > >, __gnu_cxx::__normal_iterator > >, __gnu_cxx::__normal_iterator > >)' /home/morad/Musique/workdir/library/tklibs/lib/libTkFastSimHit.so: undefined reference to 'RawHepEventFactoryFromGun::RawHepEventFactoryFromGun()' /home/morad/Musique/workdir/library/tklibs/lib/libTkLayout.so: undefined reference to 'toa::operator()(int const&) const' /home/morad/Musique/workdir/library/tklibs/lib/libTkLayout.so: undefined reference to 'FixTIDTopology::FixTIDTopology()' /home/morad/Musique/workdir/library/tklibs/lib/libTkLayout.so: undefined reference to 'DetBlade::DetBlade(__gnu_cxx::__normal_iterator > >, __gnu_cxx::__normal_iterator > >)' /home/morad/Musique/workdir/library/tklibs/lib/libTkLayout.so: undefined reference to 'toa::~toa()' /home/morad/Musique/workdir/library/tklibs/lib/libTkLayout.so: undefined reference to 'FullTracker::instance()' collect2: erreur: ld a retourné 1 code d'état d'exécution make: *** [runAnalyze] Erreur 1 Ce qui non défini dans *.so par exemple TrivialROUSetter est seulement déclaré dans un fichier .h. Il n'est n'est pas défini dans un fichier .cc. J'ai l'intuition que le compilateur g++ pour opensuse a besoin d'un flags pour ne chercher les définitions des includes *.h que s'il c'est nécessaire contrairement au g++ pour mac-os merci d'avance

mamiemando · Answer

Non g++ se comporte de la même façon a priori que tu sois sous linux ou macos.

À mon avis c'est plutôt que le ".so"  qui implémente tes objets FixTIDTopology ou toa n'est pas au même endroit et que les options -L ou -Wl,R que tu utilises pour linker n'ont pas de sens sous linux par exemple par ce que la librairie correspondante n'est pas au même endroit.

Si tu m'en dis un peu plus sur quelle(s) librairie(s) fournit ces objets et où elles sont positionnées sous linux, je pourrai te dire comment arranger tes options de compilation. Tu peux d'ores et déjà lire ceci :
https://forums.commentcamarche.net/forum/affich-27031310-compiler-avec-une-librairie-partagee

Bonne chance

hassan-phea · Answer

bonjour j'ai essayé mais j'ai pas arrivé à obtenir un bon résultat ,j'ai l'honneur de resoudre ce problème sur ce forum ,puisque j'ai pas arrivé à obtenir une solution même que j'ai ouvert une dizaine de discussions sur des dizaine des forum morad@linux-nzlc:~/workdir/layout/analyze> make mainP=runAnalyze g++ -L/home/morad/workdir/library/tklibs/lib -L/home/morad/workdir/layout/lib -L/usr/lib -Xlinker -start-group -Xlinker -lGeomPropagators -Xlinker -lPatternPrimitives -Xlinker -lSurfaceGeometry -Xlinker -lBaseMagneticField -Xlinker -lUI -Xlinker -lGenUtil -Xlinker -lSiPixelDet -Xlinker -lSmearingClusterizers -Xlinker -lBasicDet -Xlinker -lTrackFitters -Xlinker -lTkFastSimHit -Xlinker -lCommonStripDet -Xlinker -lDetLayout -Xlinker -lTkLayout -Xlinker -lDetGeometry -Xlinker -lKalmanUpdators -Xlinker -lTkCommonDet -Xlinker -lPatternTools -Xlinker -lTrajectoryParametrization -Xlinker -lxmlgeom -Xlinker -ltrack -Xlinker -lcross -Xlinker -lMaterialEffects -Xlinker -lPropagators -Xlinker -ltracking -Xlinker -lgeom -Xlinker -lStatUtilities -Xlinker -lAnalyticalJacobians -Xlinker -lxmltkgeom -Xlinker -lutils -Xlinker -lopt -Xlinker -ldraw -Xlinker -lanalyze -Xlinker -lDetVolumeGeometry -Xlinker -lPatternTestTools -Xlinker -lRKPropagators -Xlinker -lBasicStripDet -Xlinker -lDetUtilities -Xlinker -lTkNavigation -Xlinker -lNumericalJacobians -Xlinker -ltkhist -Xlinker -end-group -lxml++-2.6 -lxml2 -lglibmm-2.4 -lgobject-2.0 -lsigc-2.0 -lglib-2.0 /usr/lib/preloadable_libintl.so -L/cern/ROOT/source/root/lib /usr/lib/libX11.so -L/cern/Minuit2/5.28.00/lib -lCore -lCint -lRIO -lNet -lHist -lGraf -lGraf3d -lGpad -lTree -lRint -lPostscript -lMatrix -lPhysics -lMathCore -lThread -lfreetype -lz /usr/lib/libbz2.so.1.0.6 -pthread -Wl,-rpath,/cern/ROOT/source/root/lib -lm -ldl -L/cern/CLHEP/2.0.4.5/lib/ -lCLHEP-2.0.4.5 -O2 -lm /home/morad/workdir/layout/build/analyze/myAnalyze.o /home/morad/workdir/layout/build/analyze/runAnalyze.o -o runAnalyze.exe /usr/lib/gcc/i586-suse-linux/4.7/../../../../i586-suse-linux/bin/ld: warning: libMinuit2.so.0, needed by /home/morad/workdir/layout/lib/libxmlgeom.so, not found (try using -rpath or -rpath-link) /home/morad/workdir/library/tklibs/lib/libSmearingClusterizers.so: undefined reference to 'TrivialROUSetter::set(Module)' /home/morad/workdir/library/tklibs/lib/libTkLayout.so: undefined reference to 'FixTIDTopology::recreateTopologies()' /home/morad/workdir/library/tklibs/lib/libSmearingClusterizers.so: undefined reference to 'TkDetTypeName::shortName(DetType const&)' /home/morad/workdir/library/tklibs/lib/libTkLayout.so: undefined reference to 'DetUnitGluer::glue(__gnu_cxx::__normal_iterator > >, __gnu_cxx::__normal_iterator > >, __gnu_cxx::__normal_iterator > >, __gnu_cxx::__normal_iterator > >)' /home/morad/workdir/library/tklibs/lib/libTkFastSimHit.so: undefined reference to 'RawHepEventFactoryFromGun::RawHepEventFactoryFromGun()' /home/morad/workdir/library/tklibs/lib/libTkLayout.so: undefined reference to 'toa::operator()(int const&) const' /home/morad/workdir/library/tklibs/lib/libTkLayout.so: undefined reference to 'FixTIDTopology::FixTIDTopology()' /home/morad/workdir/library/tklibs/lib/libTkLayout.so: undefined reference to 'DetBlade::DetBlade(__gnu_cxx::__normal_iterator > >, __gnu_cxx::__normal_iterator > >)' /home/morad/workdir/library/tklibs/lib/libTkLayout.so: undefined reference to 'toa::~toa()' /home/morad/workdir/library/tklibs/lib/libTkLayout.so: undefined reference to 'FullTracker::instance()' collect2: erreur: ld a retourné 1 code d'état d'exécution make: *** [runAnalyze] Erreur 1 morad@linux-nzlc:~/workdir/layout/analyze>

mamiemando · Answer

Dans quel fichier(s)/librairie(s) sont définis FixTIDTopology, toa et FullTracker ?

hassan-phea · Answer

bonjour
en fait les variables  FixTidTopology,toa et FullTracker existent dans plusieurs fichiers *.cc et *.h .Dans mon code la commande ./myfind permet de trouver une variable dans un fichier .cc ou bien .h voici les fichiers contenant ces variables:


morad@linux-nzlc:~/workdir> ./myfind . *.h FixTIDTopology
. *.h FixTIDTopology
chercher FixTIDTopology dans les fichiers *.h se trouvant dans .
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/interface/TopologyBuilderFromXML.h:  void FixTIDTopologyAndPutInConstructMode();
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/interface/TopologyBuilder.h:  void FixTIDTopologyAndPutInConstructMode();
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/interface/FixTIDTopology.h:#ifndef FixTIDTopology_H
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/interface/FixTIDTopology.h:#define FixTIDTopology_H
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/interface/FixTIDTopology.h:class FixTIDTopology {
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/interface/FixTIDTopology.h:  FixTIDTopology();
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/interface/PartialRedigitizeTID.h: * Patch for the bug explained in FixTIDTopology. To be called in the event loop, 
morad@linux-nzlc:~/workdir> ./myfind . *.cc FixTIDTopology
. *.cc FixTIDTopology
chercher FixTIDTopology dans les fichiers *.cc se trouvant dans .
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/PartialRedigitizeTID.cc:#include "Tracker/TkLayout/interface/FixTIDTopology.h"
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/PartialRedigitizeTID.cc:  FixTIDTopology myFixTIDTopology;
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/PartialRedigitizeTID.cc:  myFixTIDTopology.recreateTopologies();
grep: ./layout/analyze/.#temp.cc: Aucun fichier ou dossier de ce type
morad@linux-nzlc:~/workdir> ./myfind . *.h toa
. *.h toa
chercher toa dans les fichiers *.h se trouvant dans .
./library/tklibs/Utilities/GenUtil/interface/ioutils.h: Usage as in:  string mystring; ... ; mystring += toa()(4.);   
./library/tklibs/Utilities/GenUtil/interface/ioutils.h:class toa {
./library/tklibs/Utilities/GenUtil/interface/ioutils.h:  inline toa(){}
./library/tklibs/Utilities/GenUtil/interface/ioutils.h:  ~toa();
./library/tklibs/Utilities/GenUtil/interface/ioutils.h:  toa(const toa&){}
./library/tklibs/Utilities/GenUtil/interface/ioutils.h:  void operator=(const toa&){}
morad@linux-nzlc:~/workdir> ./myfind . *.cc toa
. *.cc toa
chercher toa dans les fichiers *.cc se trouvant dans .
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/TkLayerName.cc:  string num; num += toa()(counter);
./library/tklibs/CommonReco/DetVolumeGeometry/test/SingleVolumeTest.cc:extern int toascii (int __c) throw ();
grep: ./layout/analyze/.#temp.cc: Aucun fichier ou dossier de ce type
morad@linux-nzlc:~/workdir> ./myfind . *.h FullTracker
. *.h FullTracker
chercher FullTracker dans les fichiers *.h se trouvant dans .
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/interface/FullTracker.h:#ifndef FullTracker_H
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/interface/FullTracker.h:#define FullTracker_H
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/interface/FullTracker.h:class FullTracker {
morad@linux-nzlc:~/workdir> ./myfind . *.cc FullTracker
. *.cc FullTracker
chercher FullTracker dans les fichiers *.cc se trouvant dans .
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/TkAllRingsDetLayerFactory.cc:#include "Tracker/TkLayout/interface/FullTracker.h"
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/TkAllRingsDetLayerFactory.cc:  DetUnitContainer dets = FullTracker::instance()->detsFromSim();
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/TkLayerName.cc:#include "Tracker/TkLayout/interface/FullTracker.h"
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/TkLayerName.cc:  LayerContainer barrelLayers = FullTracker::instance()->barrelLayers();
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/TkLayerName.cc:  LayerContainer forwardLayers = FullTracker::instance()->forwardLayers();
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/NavigationPrinter.cc:#include "Tracker/TkLayout/interface/FullTracker.h"
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/NavigationPrinter.cc:  CmsTracker::LayerContainer layers = FullTracker::instance()->allLayers();
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/TkDetTypeByName.cc:#include "Tracker/TkLayout/interface/FullTracker.h"
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/TkDetTypeByName.cc:    const CmsTracker::DetContainer& units = FullTracker::instance()->dets();
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/TkDetLayerFactoryForNumbering.cc:#include "Tracker/TkLayout/interface/FullTracker.h"
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/TkDetLayerFactoryForNumbering.cc:  const DetUnitContainer& dets = FullTracker::instance()->dets();
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/TBNumberingFactory.cc:#include "Tracker/TkLayout/interface/FullTracker.h"
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/TBNumberingFactory.cc:  vector<DetUnit*> dets = FullTracker::instance()->dets();
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/LayerAccessor.cc:#include "Tracker/TkLayout/interface/FullTracker.h"
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/LayerAccessor.cc:  theTracker( *FullTracker::instance()) {}
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/SimplePhiTkROUFactory.cc:#include "Tracker/TkLayout/interface/FullTracker.h"
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/SimplePhiTkROUFactory.cc:  DetContainer allDets = FullTracker::instance()->dets();
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/DetUnitROUDivider.cc:#include "Tracker/TkLayout/interface/FullTracker.h"
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/DetUnitROUDivider.cc:  CmsTracker::DetContainer theDet = FullTracker::instance()->detsFromSim();
./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/DetUnitROUDivider.cc:      FullTracker::instance()->dets();
grep: ./layout/analyze/.#temp.cc: Aucun fichier ou dossier de ce type
morad@linux-nzlc:~/workdir> 

au moment de link les fichiers qui contiennent  FullTracker et  FixTIDTopology se rassemblent en d'autres fichiers pour crée libTkLayout.so

mamiemando · Answer

Bon prenons une au pif, mettons celle-là :

/home/morad/workdir/library/tklibs/lib/libTkLayout.so: undefined reference to 'FixTIDTopology::recreateTopologies()'

Ici on te dit que libTkLayout.so fait référence à une méthode recreateTopologies() d'un objet FixTIDTopology. Tu as d'ailleurs reporté dans ton précédent message à quel endroit le code de cette librairie fait référence à cette méthode :

./library/tklibs/Tracker/TkLayout/src/PartialRedigitizeTID.cc:  myFixTIDTopology.recreateTopologies();

Donc cette librairie, pour compiler correctement, doit être compilée avec le ".o" issu du ".cc" qui implémente cette librairie, ou linkée avec une librairie (.so ou .a) qui fournit cet objet et cette fonction. 

D'où ma question : dans quels fichiers (.h et .cc) cette méthode est déclarée et implémentée ?

Que donne (en te plaçant dans le répertoire adéquat) :

ldd libTkLayout.so

Bonne chance

hassan-phea · Answer

merci beaucoup sur cette motivation 
la commande ldd libTkLayout.so  m'indique  morad@linux-nzlc:~/workdir/library/tklibs/lib> ldd libSmearingClusterizers.so
        linux-gate.so.1 (0xb77b6000)
        libCLHEP-2.0.4.5.so => not found
        libstdc++.so.6 => /usr/lib/libstdc++.so.6 (0xb76a2000)
        libm.so.6 => /lib/libm.so.6 (0xb7676000)
        libgcc_s.so.1 => /lib/libgcc_s.so.1 (0xb7658000)
        libc.so.6 => /lib/libc.so.6 (0xb74b1000)
        /lib/ld-linux.so.2 (0xb77b7000)
morad@linux-nzlc:~/workdir/library/tklibs/lib> ldd libTkLayout.so
        linux-gate.so.1 (0xb77b7000)
        libCLHEP-2.0.4.5.so => not found
        libstdc++.so.6 => /usr/lib/libstdc++.so.6 (0xb767e000)
        libm.so.6 => /lib/libm.so.6 (0xb7652000)
        libgcc_s.so.1 => /lib/libgcc_s.so.1 (0xb7634000)
        libc.so.6 => /lib/libc.so.6 (0xb748d000)
        /lib/ld-linux.so.2 (0xb77b8000)
morad@linux-nzlc:~/workdir/library/tklibs/lib>

mamiemando · Answer

Tu n'as répondu qu'à la moitié de ma question, mais on voit déjà que le fait que libCLHEP ne soit pas trouvé est un mauvais départ pour que cette librairie ait une chance de marcher. De plus tu as lancé ldd pour une autre librairie que celle que je t'ai demandée...

hassan-phea · Answer

au premier moment j'ai crée les qui vont stocker dans :  morad@linux-nzlc:~/workdir/library/tklibs/lib> ls
libAnalyticalJacobians.so  libDetGeometry.so        libGeomPropagators.so     libPatternTestTools.so  libSmearingClusterizers.so  libTkLayout.so
libBaseMagneticField.so    libDetLayout.so          libKalmanUpdators.so      libPatternTools.so      libStatUtilities.so         libTkNavigation.so
libBasicDet.so             libDetUtilities.so       libMaterialEffects.so     libPropagators.so       libSurfaceGeometry.so       libTrackFitters.so
libBasicStripDet.so        libDetVolumeGeometry.so  libNumericalJacobians.so  libRKPropagators.so     libTkCommonDet.so           libTrajectoryParametrization.so
libCommonStripDet.so       libGenUtil.so            libPatternPrimitives.so   libSiPixelDet.so        libTkFastSimHit.so          libUI.so
morad@linux-nzlc:~/workdir/library/tklibs/lib> 
 ces 30 librairies lorsque je fais  ldd*.soune message d'erreur commun entre ces librairies: libCLHEP-2.0.4.5.so => not found dans la deuxième stade on va créer 11 librairies*.so et on va les stocker dans un fichier morad@linux-nzlc:~/workdir/layout/lib> ls
libanalyze.so  libcross.so  libdraw.so  libgeom.so  libopt.so  libtkhist.so  libtracking.so  libtrack.so  libutils.so  libxmlgeom.so  libxmltkgeom.so
morad@linux-nzlc:~/workdir/layout/lib> 
 mais après ldd *.so un message d'erreur commun entre ces 11 librairies  libGeomPropagators.so => not found
        libPatternPrimitives.so => not found
        libSurfaceGeometry.so => not found
        libBaseMagneticField.so => not found
        libUI.so => not found
        libGenUtil.so => not found
        libCLHEP-2.0.4.5.so => not found
        libMinuit2.so.0 => not found
        libCore.so => not found
        libCint.so => not found
        libRIO.so => not found
        libNet.so => not found
        libHist.so => not found
        libGraf.so => not found
        libGraf3d.so => not found
        libGpad.so => not found
        libTree.so => not found
        libRint.so => not found
        libPostscript.so => not found
        libMatrix.so => not found
        libPhysics.so => not found
        libMathCore.so => not found
        libThread.so => not found
ce qui est en gras fait partis sur ma machine au /cern/ROOT/source/root/libe tlibCLHEP-2.0.4.5.so se trouve   /cern/CLHEP/clhep/lib/
à mon avis lorsque je vais compiler pour génerer l'excutable par le makfile  make  mainP=runAnalyze à ce moment le compilateur va chercher de remplir ces cases ce n'arrive pas a le faire!!!!?. dans mon code j'ai un makfile pour génerer les librairies library et layout  et un autre pour créer l'excutable

mamiemando · Answer

Je pense que tu vois les choses de manière trop compliquées. Tu peux mettre autant de librairies que tu veux le principe est extrêmement simple.

A) Compilation

1) Pour appeler une fonction f dans un fichier toto.c, cette fonction f doit être au préalable déclarée à l'aide d'un prototype. 

Comment : Généralement ce prototype est récupéré via un header. On peut aussi la faire d'autre manière (soit en écrivant directement le prototype en début de fichier, ce qui revient à reproduire ce qu'aurait fait l'inclusion du bon header. Mais cette approche revient à espérer que l'implémentation de cette fonction sera retrouver au linkage (voir (B)). Cette implémentation peut être retrouvée dans un module (fichier .o) ou dans une librairie (fichier .so ou .a).

Que se passe-t'il sinon : gcc refuse de compiler le toto.c et renvoie une erreur comme quoi la fonction n'a pas été déclarée.

2) Si toutes les déclarations ont été trouvées et que le fichier est syntaxiquement correct et cohérent, le fichier toto.o est produit.

B) Linkage

Le linkage revient à réunir un ensemble de fichiers binaires pour former un binaire cohérent. Un binaire peut-être :
1) un module (*.o) : c'est le résultat de la compilation d'un fichier .c
2) un exécutable (*)
3) un module de noyau (*.ko) : ça ne te concerne pas
4) une librairie ...
4)a) ... dynamique (*.so) (shared object). C'est ce que tu utilises, la librairie fait alors référence à d'autres librairies (voir ldd).
4)b) ... statique (*.a) (= stand alone), je vais passer dessus car ça ne te concerne pas ici.

Pour linker avec succès, il faut que toutes les fonctions impliquées (déclarées et utilisées) dans mon programme ait une implémentation, récupérée soit dans un .o, dans un .so ou dans .a.

Comment : il faut donner dans la ligne de compilation qui produit mon binaire tous les .so, .a et .o nécessaire à son linkage.

Que se passe-t'il sinon : supposons que le binaire que je veux compiler ait besoin d'une librairie dynamique (.so) disons libf.so, car j'ai besoin de la fonction f qu'elle fournit. Si libf n'est pas trouvée (absente du système, pas dans un répertoire "attendu"...) j'aurai une erreur "undefined reference ...". En effet mon binaire parle d'une fonction f qui a certes été déclarée (vu que j'ai passé l'étape de compilation avec succès), mais dont l'implémentation n'a jamais été trouvée.

C'est ce qui t'arrive.

Supposons maintenant que tu linkes ton binaire avec des librairies dynamiques (avec libf.so dans mon exemple). Dans ce cas, l'éditeur de lien (ld) mémorise dans ton binaire que celui-ci fait référence à libf.so. Ce sont ces liens que tu vois apparaître avec la commande ldd.

Si ldd indique des librairies "not found", cela signifie qu'elles étaient présentes au moment de la compilation de ce binaire (donc le linkage avait fonctionné à l'époque), mais depuis ces dernières ont disparues, et donc ton binaire est inutilisable en l'état.

C'est exactement ton cas pour tes 11 librairies qui font références notamment à libCore et autres. Cela signifie de plus qu'en l'état, tu ne peux sans doute pas recompiler ces 11 librairies.

C'est également ce qui t'arrive.

C) Exécution

Supposons que mon binaire était un exécutable. 

Pour que celui-ci s'exécute avec succès, toutes les librairies dynamiques avec lesquelles il est linké doivent être retrouvées. Sinon le programme plante en indiquant quelle librairie est manquante.

==> Retour sur ton problème.

Pour que ton truc ait une chance de marcher il faut que toutes les libraires nécessaires au linkage soient présentes sur ton système. Ça ne ferait pas de mal d'ailleurs de recompiler celles qui sont issues de tes sources.

Il faut bien entendu compiler tes binaires dans l'ordre. Supposons que j'ai par exemple un exécutable toto qui dépend des librairies libb1 et libb2, et que libb1 dépend de liba1, liba2 et liba3, je dois compiler dans cet ordre :
- d'abord liba1, liba2 et liba3
- maintenant je peux compiler libb1
- je dois aussi compiler libb2
- une fois que libb1 et libb2 sont compilées, je peux compiler toto.

Le rôle d'un makefile est de t'éviter d'avoir à réfléchir sur cet ordre. Il suffit juste de dire que toto dépend de libb1.so, libb2.so, et de la même manière que libb1.so dépend de liba1.so liba2.so et liba3.so. Comme ça le jour où tu recompiles toto, en cascade make se débrouille pour voir qui a besoin d'être recompilé et dans quel ordre.

Problème dans lib*.so

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