Verification du système à chaque demarrage

Bonjour,
J'ai un ordi avec un système 2000 professionnel.
Depuis un certain temps à chaque fois que je l'allume il commence sur un page noir à marquer:
Verification du syxstèm de fichier sur :
Le type du système de fichiers est FAT32.
Windons va verifier le disque...si je ne l'arrete nous avons pour 15-20 min
En le laisant aller jusqu'aubout il marque:
Windows a remplacé les clusters endommagés du fichier WINNT/ system 32 /config A pp Event. EVt nommé (null)
Windows a remplacé les clusters endommagés du fichier pagefile.sys nommé (null)
Aprés avoir terminé il verifie l'espace libre .
En tout nous avons pour 3/4 h .
J'ai defragmenté le disque et pendant quelques jours il ne l'a plus fait.
C'est grave docteur?
Le probleme ,c'est que je ne connais pas grand chose, donc impossible d'estimer si le disque dur est en train de cramer ou si c'est un virus.
Merci de m'aider.