Formater la partie Windows de mon MacOSX Core

Bonjour,

je suis en possession d'un MacOSX qui a deux ans. Il dispose d'un "côté" Mac et d'un "côté" PC.
Le coté PC est inaccessible et me demande un cd de diagnostique que je n'ai pas. Je n'ai pas non plus de cd d'installation Windows (ordinateur acheté à une entreprise).
On m'a dit qu'il suffisait que je sauvegarde mes deux disques durs (mac et pc) puis que je formate le coté Windows avec un simple CD d'installation Windows.

Est ce aussi simple ? Vu la particularité de l'ordinateur, cela ne représente pas un risque ??

Merci beaucoup d'avance.