Script concaténation deux fichier

Résolu
Bonjour,

Je viens vers vous pour vous demander un coup de main sur un script que je dois réaliser sur un serveur unix en ksh.

J'ai deux fichiers que je dois concatener en ligne en un seul.

Le premier fichier est crée comme ceci :
mag;code_art;campagne;st_juillet;st_aout;etc


Le deuxième fichier est crée comme ceci :
code_art;campagne;pma_juillet;pma_aout;etc


et le fichier final doit etre comme cela :
mag;code_art;campagne;st_juillet;st_aout;etc;pma_juillet;pma_aout;etc...


Si vous pouviez m'aider ce serait extra parceque la je suis paumé depuis la première ligne

Merci d'avance à tous

Steph70
Configuration: Windows XP
Safari 530.5

37 réponses

Résumé de la discussion

La discussion porte sur la concaténation en ligne de deux fichiers CSV sous Unix en ksh, afin d'obtenir un fichier final regroupant les colonnes des deux sources. Plusieurs propositions visent à étendre join et à trier les données par code_art et campagne, avec des ajustements de formatage (séparateurs et colonnes vides) et l'utilisation de sed, awk ou perl. Des essais alternent entre for en ksh, création de fichiers temporaires par campagne et tentatives de jointure multiple, certaines évoquant des volumes proches de 400 000 lignes, donc sensibles à la performance. Des arguments émergent pour éviter join sur de grands ensembles et privilégier une fusion via awk ou Perl, ou des scripts dédiés, afin d'obtenir les colonnes manquantes sans réorganisation lourde.

Bobot (l’IA à votre service)
  1. Modérateur
    Donc il faut que tu jartes les doublons en même temps c'est ça?

    Je connais pas ksh, mais à ce que je vois, l'emploi du for semble être comme dans bash.
    Ca devrait ressembler à un truc du genre:

    all=""
    
    for $fichier in "fichier1 fichier2"
        for $token in "sed 's/;/ /' $fichier"
        do
            found=false
            for $elm in $all
            do
                if $elm == $token
                then
                    found = true
                fi
            done
            if $found == false
            then
                all="$all $token"
                echo $token >> fichier_union
            fi
        done
    done

    Ou quelque chose dans ce goût là.
    1. Bonjour Killian et merci pour ta réponse.

      je ne saisis pas totalement le script (désolé je suis un peu débutant) et celui me dit qu'il y a une erreur au for en ligne 4.

      Par hasard, après un FOR, il n'y a pas un "do" ?

      Et je ne saisis pas la variable tolken.

      Merci encore pour ton aide.

      Amicalement
      Steph70
      1. Modérateur
        Salut,

        Pourquoi pas
        cat fic1 fic2 > fic3 && perl -pi -e 's/\n/;/' fic3
        --
        106485010510997108
        1. Modérateur
          Salut,

          Il y a combien de champs sur chaque ligne ?

          Parce qu'il existe la commande "join" :
          ssh$ cat fich fic
          mag;code_art;campagne;st_juillet;st_aout;etc
          code_art;campagne;pma_juillet;pma_aout;etc
          
          ssh$ join -t';' -1 2 -2 1 -o '1.1,1.2,1.3,1.4,1.5,1.6,2.3,2.4,2.5'  fich fic
          mag;code_art;campagne;st_juillet;st_aout;etc;pma_juillet;pma_aout;etc
          
          ssh$
          ;-))
          1. Merci a tous,

            Le souci est que les deux fichiers ne peuvent pas simplement être joint, il faut que les lignes du premier correspondent bien aux lignes du deuxième.

            Ce que je veux dire c'est que dans le premier fichier, la première ligne ne correspond pas forcément à la première ligne du deuxième.

            De plus, a priori, il me semble que join n'affichera pas les lignes vides d'un des deux fichiers. Exemple, j'ai bien du st_juillet mais en face je n'ai pas de pma_juillet.

            Merci quand même pour votre aide précieuse, vous êtes tous super.

            Amicalement
            Steph70
            1. Bonjour,

              J'ai essayé join mais ca coince et j'ai un message d'erreur
              unexpected operator
              


              A l'aide

              Amicalement
              Steph70
              1. Modérateur
                Merci d'afficher les fichiers, la commande et le message d'erreur (copier/coller du terminal).
            2. Pardon, est allé un peu vite.

              voici le script en complet .

              while [ `cat D_STO2.CSV` -ne EOF ];do
              join -t';' -1 2 -2 1 -o '1.1,1.2,1.3,1.4,1.5,1.6,1.7,1.8,1.9,1.10,1.11,1.12,1.13,1.14,1.15,2.3,2.4,2.5,2.6,2.7,2.8,2.9,2.10,2.11,2.12,2.13,2.14' D_STO2.CSV D_PMA2.CSV >>stockpma.csv
              done
              


              Merci pour votre aide
              Steph70
              1. Pardon,

                le script ne comprend que la ligne "join", le reste est inutile.

                Par contre, j'ai un deuxième champs (campagne) qui devrait être utilisé pour le tri et à priori ca n'est pas possible avec join.

                J'ai bien pensé a faire des fichiers temporaires par campagne mais c'est extremement long. (y a un peu plus de 400 000lignes.

                Si vous avez une idée.

                Merci
                Amicalement
                Steph70
                1. Modérateur
                  Sans des exemples des fichiers d'entrée c'est difficile de comprendre pourquoi la commande "join" merdoie ;-(
                  1. Si tu veux voici un exemple.

                    Le premier fichier comprend ceci :
                    mag;code_art;campagne;st_juillet;st_aout;etc
                    201;106;2007;12;23;etc
                    201;206;2008;11;13;etc
                    113;206;2007;12;14;etc
                    112;208;2008;34;25;etc


                    Le deuxième fichier comprend cela :
                    code_art;campagne;pma_juillet;pma_aout;etc
                    206;2007;112;118,etc
                    201;2008;115;120;etc
                    206;2008;175;195;etc
                    106;2007;340;152;etc
                    208;2008;32;12;etc
                    etc.........</cotde>
                    
                    et le fichier final devrait ressembler à cela : 
                    <code>mag;code_art;campagne;st_juillet;st_aout;etc;pma_juillet;pma­_aout;etc
                    201;206;2008;11;13;etc;112;118;etc
                    201;106;2007;12;23;etc;340;152;etc
                    112;208;2008;34;25;etc;32;12;etc


                    Amicalement
                    Steph70
                    1. Ce qui fait que je devrais faire 2 jointures : une sur le code_art et l'autre sur la campagne.

                      Merci encore pour votre aide précieuse

                      Amicalement
                      steph70
                      1. Modérateur
                        Ça ne pourra malheureusement pas marcher avec join ;-((

                        Extrait du man :
                               fichier_1 et fichier_2 doivent être préalablement triés en ordre crois-
                               sant (pas nécessairement numérique) sur  leur  champ  utilisé  pour  la
                               fusion.
                        Désolé ;-(
                        1. Contributeur
                          hello
                          comment arrives-tu à ces lignes avec les deux fichiers ?
                          201;206;2008;11;13;etc;112;118;etc
                          201;106;2007;12;23;etc;340;152;etc
                          112;208;2008;34;25;etc;32;12;etc
                          1. Bonjour,

                            Ben justement c'est la question. Comment faire pour arriver à ce resultat.

                            Amicalement
                            Steph70
                            1. Contributeur
                              je te demande quelle est la logique, méthode,intention,algorithme pour arriver à ça
                              201;206;2008;11;13;etc;112;118;etc
                              201;106;2007;12;23;etc;340;152;etc
                              112;208;2008;34;25;etc;32;12;etc

                              avec
                              201;106;2007;12;23;etc
                              201;206;2008;11;13;etc
                              113;206;2007;12;14;etc
                              112;208;2008;34;25;etc
                              et
                              206;2007;112;118,etc
                              201;2008;115;120;etc
                              206;2008;175;195;etc
                              106;2007;340;152;etc
                              208;2008;32;12;etc
                              1. Ah ok, désolé, je suis un peu lent à la comprenote

                                Et bien on compare les deux champs communs des fichiers que sont code_art et campagne, si les deux champs sont identiques on les inscrits en ligne dans un troisième fichiers en prenant soin malgré tout de ne pas inscrire ne double les champs de fusion (code_art et campagne)

                                Après quelques recherches, il me semble que cela doit être possible avec awk et FR et NFR

                                Mais malgré les exemples trouvés de ci dela sur le net, je n'arrive pas à mettre en forme.

                                Y a t'il u pro de awk par ici ?

                                Merci encore pour votre aide

                                Amicalement
                                Steph70
                                1. Webmaster
                                  Olà,

                                  Awk ne me parait pas le plus judicieux, il n'est pas fait pour lire & ttraiter deux fichiers simultanément :)

                                  Perso, j'utiliserait join, comme jp.

                                  Etant donné que join ne sait pas faire de jointure sur plus d'un champ, il faut commencer par deux petites transformations pour n'avoir qu'un seul champ!
                                  #!/bin/bash
                                  cat > fic1 << EOF
                                  mag;code_art;campagne;st_juillet;st_aout;etc
                                  201;106;2007;12;23;etc
                                  201;206;2008;11;13;etc
                                  113;206;2007;12;14;etc
                                  112;208;2008;34;25;etc
                                  EOF
                                  
                                  
                                  cat > fic2 << EOF
                                  code_art;campagne;pma_juillet;pma_aout;etc
                                  206;2007;112;118,etc
                                  201;2008;115;120;etc
                                  206;2008;175;195;etc
                                  106;2007;340;152;etc
                                  208;2008;32;12;etc
                                  EOF
                                  
                                  # 1: Transformer code_art;campagne en code_art@camapagne, et trier le fichier numeriquement sur le champ 2
                                  sed -r 's/^([^;]+);([^;]+);([^;]+);(.*)$/\1;\2@\3;\4/' fic1 |sort -n -t ';' -k 2 > fic1.mod
                                  
                                  # 1: Transformer code_art;campagne en code_art@camapagne, et trier le fichier numeriquement sur le champ 1
                                  sed -r 's/^([^;]+);([^;]+);(.*)$/\1@\2;\3/' fic2 |sort -n -t ';' -k 1 > fic2.mod
                                  
                                  #3: Joindre les fichiers sur les champ 2 du fichier 1 et 1 du fichier2, remettre le champ mag à la bonne place, et separer le champ code_art@campagne en deux champ distincts
                                  join -1 2 -2 1 -t ';' fic1.mod fic2.mod | sed -r 's/^(.+)@([^;]+);([^;]+);(.*)$/\3;\1;\2;\4/'


                                  A prioris, ça semble faire l'affaire sur les exemple donnés :)

                                  a plus

                                  PS: j'ai utiliser l'arobase en me basant sur l'idée qu'il ne devrait apparaitre à aucun autre endroit dans les fichiers, c'est fesable avec l'underscore, mais moins générique, ou avec tout autre caractère nonprésent :)
                                  1. Webmaster
                                    PS2:

                                    J'avais pas vu que les fichiers étaient très volumineux... mais sans fichiers temporaires ça ne me parait difficilement jouable...

                                    Elle viennent d'ou ces données ? Si lle viennent d'une base de donnée, il faudrait extraire directement le fichier voulu (c'est une opération bien plus simple en sql, qu'en shell, d'ailleurs c'est a ça que ça sert)...
                                    1. Modérateur
                                      Salut,

                                      J'ai la nette impression que tu t'es cassé les nénettes pour pas grand chose ;-((

                                      Si on en croit sa dernière explication la correspondance des champs ne se fait pas sur la même ligne des 2 fichiers joins côte à côte, mais sur la correspondance des champs de n'importe quelle ligne (enfin d'après les explications) ;-((

                                      Résultat escompté :
                                      201;206;2008;11;13;etc;112;118;etc
                                      201;106;2007;12;23;etc;340;152;etc
                                      112;208;2008;34;25;etc;32;12;etc 
                                      Résultat d'un paste :
                                      $ paste  fich1 fich2
                                      
                                      201;106;2007;12;23;etc  206;2007;112;118,etc
                                      201;206;2008;11;13;etc  201;2008;115;120;etc
                                      113;206;2007;12;14;etc  206;2008;175;195;etc
                                      112;208;2008;34;25;etc  106;2007;340;152;etc
                                              208;2008;32;12;etc
                                      
                                      ;-((((

                                    2. Webmaster
                                      @jipicyBen pour moi, c'est une erreur dans la sortie exemple :) il a bien dit que ça devait être join sur code_art & campagne, en quel cas, la première ligne de l'exemple donné est fausse, puissque s'il s'agit bien du même article, les campagne ne sont pas les mêmes :)

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