Transition vers linux

Bonjour,
j'ai besoin d'avis pour m'aider dans un choix de stratégie. je veux essayer de passer sous Linux, mais en commençant par un "moyen amovible" car je suis nomade (en plus !!). une machine à la maison (windaube XP) et une au bureau. Pour l'instant des clé usb me conviennent bien. Maintenant, j'ai deux choix: continuer avec une clé avec un système Linux ou un petit disque dur externe. Je ne connais pas la différence de vitesse d'accès et de travail des deux principes. De plus je pense que je me buterais rapidement avec la notion de capacité et de démarrage
Avez-vous des suggestions. Merci