Récupération de fichier

Bonjour,

Dans mon entreprise nous devons récupérer des fichier sur une machine, pour l'instant nous faisons cela manuellement avec FileZilla, mais nous aimerions automatiser cela. Le problème est que ce n'est pas toujours la même arborescence, parfois il y a plus ou moins de fichier et de sous dossier. Nous avons essayer de créer un script ftp qui nous permettrais de tout récupéré mais sans succès à cause du changement d'arborescence un peu aléatoire. Connaitriez-vous un logiciel ou même un script qui permettrais de récupérer tout le dossier parents?

J'espère que ma demande est clair, merci.