Concantener des fichiers par pair en fonction de leur nom

jawad -  
 jawad -
Bonjour,
J'ai un grand nombre de fichier texte que je veux concantener par paire en evitant de le faire paire par paire !
les noms sont du type:
fichier1.fastq
newfichier1_new.fastq
fichier2.fastq
newfichier2_new.fastq
etc...
Auriez-vous une idée de script pour faire ça en batch?
Merci d'avance!


1 réponse

dubcek Messages postés 18789 Date d'inscription   Statut Contributeur Dernière intervention   5 637
 
hello
comment doivent s'appeller les fichiers de destination ?
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jawad
 
fichier1total.fastq
fichier2total.fastq
merci!
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dubcek Messages postés 18789 Date d'inscription   Statut Contributeur Dernière intervention   5 637
 
pour voir ce qu'il va faire
for f in fich*; do echo "cat $f " new${f%%.*}* " > ${f%%.*}total.fastq"; done

pour effectuer
for f in fich*; do cat $f new${f%%.*}* > ${f%%.*}total.fastq; done
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jawad > dubcek Messages postés 18789 Date d'inscription   Statut Contributeur Dernière intervention  
 
Merci beaucoup! après un peu de bidouille (les noms n'avaient en fait pas exactement cette structure!), ça fonctionne parfaitement!
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