Concantener des fichiers par pair en fonction de leur nom

jawad -  
 jawad -
Bonjour,
J'ai un grand nombre de fichier texte que je veux concantener par paire en evitant de le faire paire par paire !
les noms sont du type:
fichier1.fastq
newfichier1_new.fastq
fichier2.fastq
newfichier2_new.fastq
etc...
Auriez-vous une idée de script pour faire ça en batch?
Merci d'avance!

1 réponse

  1.
    dubcek Messages postés 18627 Date d'inscription   Statut Contributeur Dernière intervention   5 660
     
    hello
    comment doivent s'appeller les fichiers de destination ?
    0
    1. jawad
       
      fichier1total.fastq
      fichier2total.fastq
      merci!
      0
    2. dubcek Messages postés 18627 Date d'inscription   Statut Contributeur Dernière intervention   5 660
       
      pour voir ce qu'il va faire 
      for f in fich*; do echo "cat $f " new${f%%.*}* " > ${f%%.*}total.fastq"; done

      pour effectuer 
      for f in fich*; do cat $f new${f%%.*}* > ${f%%.*}total.fastq; done
      0
      1. jawad > dubcek Messages postés 18627 Date d'inscription   Statut Contributeur Dernière intervention  
         
        Merci beaucoup! après un peu de bidouille (les noms n'avaient en fait pas exactement cette structure!), ça fonctionne parfaitement!
        0

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