Ajout d'un SSD devenant disque système

Hello

Je viens détailler mon problème qui est très peu traité sur le net voire pas du tout.
Beaucoup de tutos détaillent comment REMPLACER son HDD par un SSD.
Mais aucun n'explique comment ajouter un SSD en le faisant devenir disque système à la place du HDD en gardant le HDD en tant que disque secondaire.

Le problème vient surtout de mes partitions, j'explique ma situation :

Avant :
J'avais un HDD, avec partition C: contenant mon OS et une partition D: et E: contenant des documents.

Maintenant :
J'ai installé et cloné mon HDD sur mon nouveau SSD comme décrit dans les différents tutos sur le net.
Problème ? Mon SSD est maintenant sur les partitions L: (OS) et M: N:

http://image.noelshack.com/fichiers/2015/04/1422199919-ssd.png

J'ai donc maintenant deux disques systèmes.
En modifiant le séquençage de boot dans le Bios, j'ai l'impression que mon OS boot maintenant bien sur mon SSD mais sous Windows, tous les chemins par défaut, tous les programmes pointent toujours vers le C: , le bureau pareil, du coup je travaille toujours autant avec HDD.

J'aimerai pouvoir formater mon HDD et faire de mon SSD le seul disque système, si possible en renommant les partitions. J'ai déjà utilisé l'utilitaire Windows pour modifier la lettre de mon lecteur C: vers autre chose il me jette. Et du coup mon HDD reste le disque système :/

http://image.noelshack.com/fichiers/2015/04/1422200285-ssd2.png

Merci