Mettre , des lignes d'un fichier dans une

julie -  
 juliee -
bonjour j'ai un fichier avec des séquence c'est à dire differents groupes de lignes je veux mettre chaque groupe dans une liste les grourpes de lignes sont ds un intervalle comment fair poour defiinir l'intervallle merci julie
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5 réponses

Pitu Messages postés 1460 Statut Contributeur 125
 
Bonjour Julie,

J'ai pas bien compris ce que tu souhaites faire, et j'ai peur de ne pas être le seul ...
Je crois pouvoir imaginer à quoi ressemble ton fichier, mais de quel type est-il ?
Sur quelle plate-forme ? Dos, Unix, MVS, ... ?
De quels outils disposes-tu pour faire ça ?

Essayes de nous en dire un peu plus.

a +

 
   (:•Þ  Pitu
0
julie
 
SALUT PITOU
je travial sous windos

je veux fair un programme en perl a partir d' un fichier text
mon fichier :
>hg13_ensGene_ENST00000292304_0 range=chr1:151849696-151850313 5'pad=25 3'pad=25 revComp=FALSE strand=+ repeatMasking=none
tagagcctttgccccggcgtcggtgACTCAGTGTTCGCGGGAGCGCCGCA
CCTACACCAGCCAACCCAGATCCCGAGGTCCGACAGCGCCCGGCCCAGAT
CCCCACGCCTGCCAGGAGCAAGCCGAGAGCCAGCCGGCCGGCGCACTCCG
ACTCCGAGCAGTCTCTGTCCTTCGACCCGAGCCCCGCGCCCTTTCCGGGA
CCCCTGCCCCGCGGGCAGCGCTGCCAACCTGCCGGCCATGGAGACCCCGT
CCCAGCGGCGCGCCACCCGCAGCGGGGCGCAGGCCAGCTCCACTCCGCTG
TCGCCCACCCGCATCACCCGGCTGCAGGAGAAGGAGGACCTGCAGGAGCT
CAATGATCGCTTGGCGGTCTACATCGACCGTGTGCGCTCGCTGGAAACGG
AGAACGCAGGGCTGCGCCTTCGCATCACCGAGTCTGAAGAGGTGGTCAGC
CGCGAGGTGTCCGGCATCAAGGCCGCCTACGAGGCCGAGCTCGGGGATGC
CCGCAAGACCCTTGACTCAGTAGCCAAGGAGCGCGCCCGCCTGCAGCTGG
AGCTGAGCAAAGTGCGTGAGGAGTTTAAGGAGCTGAAAGCGCGgtgagtt
cgcccaggtggctgcgtg
>hg13_ensGene_ENST00000292304_1 range=chr1:151865606-151865812 5'pad=25 3'pad=25 revComp=FALSE strand=+ repeatMasking=none
atctactctcccctctcttctttagCAATACCAAGAAGGAGGGTGACCTG
ATAGCTGCTCAGGCTCGGCTGAAGGACCTGGAGGCTCTGCTGAACTCCAA
GGAGGCCGCACTGAGCACTGCTCTCAGTGAGAAGCGCACGCTGGAGGGCG
AGCTGCATGATCTGCGGGGCCAGGTGGCCAAGgtgaggccaccctgcagg
gcccacc
>hg13_ensGene_ENST00000292304_2 range=chr1:151869392-151869567 5'pad=25 3'pad=25 revComp=FALSE strand=+ repeatMasking=none
ctcatctctgcctgcttcctcacagCTTGAGGCAGCCCTAGGTGAGGCCA
AGAAGCAACTTCAGGATGAGATGCTGCGGCGGGTGGATGCTGAGAACAGG
CTGCAGACCATGAAGGAGGAACTGGACTTCCAGAAGAACATCTACAGTGA
Ggtggggactgtgctttgcaagccag
>hg13_ensGene_ENST00000292304_3 range=chr1:151869794-151870014 5'pad=25 3'pad=25 revComp=FALSE strand=+ repeatMasking=none
tgtgtccttcctccaacccttccagGAGCTGCGTGAGACCAAGCGCCGTC
ATGAGACCCGACTGGTGGAGATTGACAATGGGAAGCAGCGTGAGTTTGAG
AGCCGGCTGGCGGATGCGCTGCAGGAACTGCGGGCCCAGCATGAGGACCA
GGTGGAGCAGTATAAGAAGGAGCTGGAGAAGACTTATTCTGCCAAGgtgc
ttgctctcgattggttccctc
>hg13_ensGene_ENST00000292304_4 range=chr1:151870176-151870351 5'pad=25 3'pad=25 revComp=FALSE strand=+ repeatMasking=none
cctaaccctttgtcctcccctccagCTGGACAATGCCAGGCAGTCTGCTG
AGAGGAACAGCAACCTGGTGGGGGCTGCCCACGAGGAGCTGCAGCAGTCG
CGCATCCGCATCGACAGCCTCTCTGCCCAGCTCAGCCAGCTCCAGAAGCA
Ggtgataccccacctcacccctctct
>hg13_ensGene_ENST00000292304_5 range=chr1:151870890-151871160 5'pad=25 3'pad=25 revComp=FALSE strand=+ repeatMasking=none
accaaaccctcccaccccccttcagCTGGCAGCCAAGGAGGCGAAGCTTC
GAGACCTGGAGGACTCACTGGCCCGTGAGCGGGACACCAGCCGGCGGCTG
CTGGCGGAAAAGGAGCGGGAGATGGCCGAGATGCGGGCAAGGATGCAGCA
GCAGCTGGACGAGTACCAGGAGCTTCTGGACATCAAGCTGGCCCTGGACA
TGGAGATCCACGCCTACCGCAAGCTCTTGGAGGGCGAGGAGGAGAGgtgg
gctggggagacgtcggggagg
>hg13_ensGene_ENST00000292304_6 range=chr1:151871203-151871427 5'pad=25 3'pad=25 revComp=FALSE strand=+ repeatMasking=none
ccccacttggtctccctctccccagGCTACGCCTGTCCCCCAGCCCTACC
TCGCAGCGCAGCCGTGGCCGTGCTTCCTCTCACTCATCCCAGACACAGGG
TGGGGGCAGCGTCACCAAAAAGCGCAAACTGGAGTCCACTGAGAGCCGCA
GCAGCTTCTCACAGCACGCACGCACTAGCGGGCGCGTGGCCGTGGAGGAG
gtggatgaggagggcaagtttgtcc
>hg13_ensGene_ENST00000292304_7 range=chr1:151872688-151872800 5'pad=25 3'pad=25 revComp=FALSE strand=+ repeatMasking=none
ggtgcgctcagtgactgtggttgagGACGACGAGGATGAGGATGGAGATG
ACCTGCTCCATCACCACCACGTGAGTGGTAGCCGCCGCtgaggccgagcc
tgcactggggcca
ce sont des séquences ADN
j'aiimerai mettree chaque séquence dans des liste

merci bcp
ps je debute 'en p erl
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Pitu Messages postés 1460 Statut Contributeur 125
 
Eh ben ... bon courage !
Et place aux autres, parce que là, j'y connais rien.

Désolé ...

 
   (:•Þ  Pitu
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WhiteFang Messages postés 2063 Statut Membre 204
 
;-)

ATGC, c'est la séquence ADN...

Par contre, désolé, je connais pas perl... Sous Vb/VBA, j'aurais pu, mais là...

Ton truc, c'est une analyse séquencielle de diff. génomes ?

;-)

Wild and Free
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juliee
 
oui c'est des séquences ADN
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