Mettre , des lignes d'un fichier dans une

julie -  
 juliee -
bonjour j'ai un fichier avec des séquence c'est à dire differents groupes de lignes je veux mettre chaque groupe dans une liste les grourpes de lignes sont ds un intervalle comment fair poour defiinir l'intervallle merci julie

5 réponses

  1. Pitu Messages postés 1460 Statut Contributeur 125
     
    Bonjour Julie,

    J'ai pas bien compris ce que tu souhaites faire, et j'ai peur de ne pas être le seul ...
    Je crois pouvoir imaginer à quoi ressemble ton fichier, mais de quel type est-il ?
    Sur quelle plate-forme ? Dos, Unix, MVS, ... ?
    De quels outils disposes-tu pour faire ça ?

    Essayes de nous en dire un peu plus.

    a +

     
       (:•Þ  Pitu
    0
  2. julie
     
    SALUT PITOU
    je travial sous windos

    je veux fair un programme en perl a partir d' un fichier text
    mon fichier :
    >hg13_ensGene_ENST00000292304_0 range=chr1:151849696-151850313 5'pad=25 3'pad=25 revComp=FALSE strand=+ repeatMasking=none
    tagagcctttgccccggcgtcggtgACTCAGTGTTCGCGGGAGCGCCGCA
    CCTACACCAGCCAACCCAGATCCCGAGGTCCGACAGCGCCCGGCCCAGAT
    CCCCACGCCTGCCAGGAGCAAGCCGAGAGCCAGCCGGCCGGCGCACTCCG
    ACTCCGAGCAGTCTCTGTCCTTCGACCCGAGCCCCGCGCCCTTTCCGGGA
    CCCCTGCCCCGCGGGCAGCGCTGCCAACCTGCCGGCCATGGAGACCCCGT
    CCCAGCGGCGCGCCACCCGCAGCGGGGCGCAGGCCAGCTCCACTCCGCTG
    TCGCCCACCCGCATCACCCGGCTGCAGGAGAAGGAGGACCTGCAGGAGCT
    CAATGATCGCTTGGCGGTCTACATCGACCGTGTGCGCTCGCTGGAAACGG
    AGAACGCAGGGCTGCGCCTTCGCATCACCGAGTCTGAAGAGGTGGTCAGC
    CGCGAGGTGTCCGGCATCAAGGCCGCCTACGAGGCCGAGCTCGGGGATGC
    CCGCAAGACCCTTGACTCAGTAGCCAAGGAGCGCGCCCGCCTGCAGCTGG
    AGCTGAGCAAAGTGCGTGAGGAGTTTAAGGAGCTGAAAGCGCGgtgagtt
    cgcccaggtggctgcgtg
    >hg13_ensGene_ENST00000292304_1 range=chr1:151865606-151865812 5'pad=25 3'pad=25 revComp=FALSE strand=+ repeatMasking=none
    atctactctcccctctcttctttagCAATACCAAGAAGGAGGGTGACCTG
    ATAGCTGCTCAGGCTCGGCTGAAGGACCTGGAGGCTCTGCTGAACTCCAA
    GGAGGCCGCACTGAGCACTGCTCTCAGTGAGAAGCGCACGCTGGAGGGCG
    AGCTGCATGATCTGCGGGGCCAGGTGGCCAAGgtgaggccaccctgcagg
    gcccacc
    >hg13_ensGene_ENST00000292304_2 range=chr1:151869392-151869567 5'pad=25 3'pad=25 revComp=FALSE strand=+ repeatMasking=none
    ctcatctctgcctgcttcctcacagCTTGAGGCAGCCCTAGGTGAGGCCA
    AGAAGCAACTTCAGGATGAGATGCTGCGGCGGGTGGATGCTGAGAACAGG
    CTGCAGACCATGAAGGAGGAACTGGACTTCCAGAAGAACATCTACAGTGA
    Ggtggggactgtgctttgcaagccag
    >hg13_ensGene_ENST00000292304_3 range=chr1:151869794-151870014 5'pad=25 3'pad=25 revComp=FALSE strand=+ repeatMasking=none
    tgtgtccttcctccaacccttccagGAGCTGCGTGAGACCAAGCGCCGTC
    ATGAGACCCGACTGGTGGAGATTGACAATGGGAAGCAGCGTGAGTTTGAG
    AGCCGGCTGGCGGATGCGCTGCAGGAACTGCGGGCCCAGCATGAGGACCA
    GGTGGAGCAGTATAAGAAGGAGCTGGAGAAGACTTATTCTGCCAAGgtgc
    ttgctctcgattggttccctc
    >hg13_ensGene_ENST00000292304_4 range=chr1:151870176-151870351 5'pad=25 3'pad=25 revComp=FALSE strand=+ repeatMasking=none
    cctaaccctttgtcctcccctccagCTGGACAATGCCAGGCAGTCTGCTG
    AGAGGAACAGCAACCTGGTGGGGGCTGCCCACGAGGAGCTGCAGCAGTCG
    CGCATCCGCATCGACAGCCTCTCTGCCCAGCTCAGCCAGCTCCAGAAGCA
    Ggtgataccccacctcacccctctct
    >hg13_ensGene_ENST00000292304_5 range=chr1:151870890-151871160 5'pad=25 3'pad=25 revComp=FALSE strand=+ repeatMasking=none
    accaaaccctcccaccccccttcagCTGGCAGCCAAGGAGGCGAAGCTTC
    GAGACCTGGAGGACTCACTGGCCCGTGAGCGGGACACCAGCCGGCGGCTG
    CTGGCGGAAAAGGAGCGGGAGATGGCCGAGATGCGGGCAAGGATGCAGCA
    GCAGCTGGACGAGTACCAGGAGCTTCTGGACATCAAGCTGGCCCTGGACA
    TGGAGATCCACGCCTACCGCAAGCTCTTGGAGGGCGAGGAGGAGAGgtgg
    gctggggagacgtcggggagg
    >hg13_ensGene_ENST00000292304_6 range=chr1:151871203-151871427 5'pad=25 3'pad=25 revComp=FALSE strand=+ repeatMasking=none
    ccccacttggtctccctctccccagGCTACGCCTGTCCCCCAGCCCTACC
    TCGCAGCGCAGCCGTGGCCGTGCTTCCTCTCACTCATCCCAGACACAGGG
    TGGGGGCAGCGTCACCAAAAAGCGCAAACTGGAGTCCACTGAGAGCCGCA
    GCAGCTTCTCACAGCACGCACGCACTAGCGGGCGCGTGGCCGTGGAGGAG
    gtggatgaggagggcaagtttgtcc
    >hg13_ensGene_ENST00000292304_7 range=chr1:151872688-151872800 5'pad=25 3'pad=25 revComp=FALSE strand=+ repeatMasking=none
    ggtgcgctcagtgactgtggttgagGACGACGAGGATGAGGATGGAGATG
    ACCTGCTCCATCACCACCACGTGAGTGGTAGCCGCCGCtgaggccgagcc
    tgcactggggcca
    ce sont des séquences ADN
    j'aiimerai mettree chaque séquence dans des liste

    merci bcp
    ps je debute 'en p erl
    0
  3. Pitu Messages postés 1460 Statut Contributeur 125
     
    Eh ben ... bon courage !
    Et place aux autres, parce que là, j'y connais rien.

    Désolé ...

     
       (:•Þ  Pitu
    0
  4. WhiteFang Messages postés 2063 Statut Membre 204
     
    ;-)

    ATGC, c'est la séquence ADN...

    Par contre, désolé, je connais pas perl... Sous Vb/VBA, j'aurais pu, mais là...

    Ton truc, c'est une analyse séquencielle de diff. génomes ?

    ;-)

    Wild and Free
    0
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